Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3584924	3585258	335	53 [0]	[0] 55	yihI	conserved hypothetical protein

GATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGAA  >  W3110S.gb/3585259‑3585320 |                                                              gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:703978/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:306656/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:346864/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:351040/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:377762/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:415323/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:421761/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:45436/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:510754/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:531832/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:561475/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:664439/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:675730/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:696660/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:266310/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:724516/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:725996/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:780997/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:803173/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:804140/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:831688/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:855594/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:856461/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:890574/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:8993/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:925736/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:945476/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:976025/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1286883/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1007230/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1019253/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1054626/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1064768/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1073057/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1089518/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1180104/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1195063/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1207375/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1220148/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1224592/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1264608/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1269619/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1004745/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1288605/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1387598/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1450045/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1455190/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1459233/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1462686/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:1515929/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:152152/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:184347/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:201317/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:205375/62‑1 (MQ=255) gATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGaa  <  1:229461/62‑1 (MQ=255) |                                                              GATCCAGCTCCTCGCGTGTTTTTCGACGCGCTTTTGCATGACCTTTGCTGCGTGAGTTTGAA  >  W3110S.gb/3585259‑3585320

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑