Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3659710	3659734	25	144 [0]	[0] 48	wzxE	O‑antigen translocase

CATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACGG  >  W3110S.gb/3659735‑3659803 |                                                                     cATGAGCGTAAATTTGCTCGACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:365924/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:562864/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:389231/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:389654/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:393538/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:399024/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:453471/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:454008/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:455381/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:527707/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:553384/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:559843/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:1078545/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:593707/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:720207/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:744050/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:745263/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:893100/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:912643/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:915705/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:929379/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:960320/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:982170/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:1500008/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:1008058/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:1082908/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:1095856/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:1136114/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:1151612/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:1244549/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:126558/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:1273456/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:134899/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:136231/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:1442739/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:1445371/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:336306/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:15157/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:1560765/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:1569357/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:1582054/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:168796/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:193073/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:276263/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:282061/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:294229/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCAGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACgg  >  1:365688/1‑69 (MQ=255) cATGAGCGTAAATTTGCTCAACAGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAg                         >  1:350397/1‑46 (MQ=255) |                                                                     CATGAGCGTAAATTTGCTCAACTGCCCTGCCAGACCGTTATCCCAGCTGGGTTTCAGATAGCTTAACGG  >  W3110S.gb/3659735‑3659803

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑