Missing coverage evidence...
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TTGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGAGAG  >  W3110S.gb/312122‑312190 |                                                                     ttGTTATCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:667027/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:507224/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:300616/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:301204/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:39657/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:406830/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:407396/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:435406/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:437220/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:445640/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:448880/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1025142/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:544889/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:593956/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:632522/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:649870/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:680158/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:749720/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:848241/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:884622/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:203948/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1004635/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1033097/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1111617/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1139061/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1185279/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1194276/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1230082/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1290148/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1324291/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1409113/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:141527/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1426105/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1440173/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1463551/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1500397/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:1606941/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:180373/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:182443/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGagag  <  1:267886/69‑1 (MQ=255) ttGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGGTTTGCTGagag  <  1:884778/69‑1 (MQ=255) |                                                                     TTGTTAGCAGCCATTGGTGACGCTCCCATAAACGCCTGGATGAGTGATTGATGATGGTTTTGCTGAGAG  >  W3110S.gb/312122‑312190

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑