Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	312413	312543	131	194 [0]	[0] 37	ykgM/eaeH	predicted ribosomal protein/attaching and effacing protein, pathogenesis factor

TTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGA  >  W3110S.gb/312544‑312611 |                                                                    ttGAGATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:214267/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCGCAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:713066/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGTATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:630784/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTAGATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:1575161/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:549705/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:376940/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:396929/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:404794/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:423889/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:489517/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:509888/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:52834/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:334916/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:579545/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:610237/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:726802/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:728672/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:742304/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:892103/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:961629/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:1426636/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:1101657/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:1155253/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:1155590/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:1304041/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:1334149/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:134221/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:1399728/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:140073/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:348957/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:1495586/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:1550889/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:1557511/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:216178/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:238346/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:1076630/68‑1 (MQ=255) ttGACATGTATCACAAATATGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGa  <  1:238354/68‑1 (MQ=255) |                                                                    TTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATTGCACCAACGTCATTGA  >  W3110S.gb/312544‑312611

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑