Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3809680	3809837	158	72 [0]	[0] 50	yicH	conserved hypothetical protein

CTCGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGAAAA  >  W3110S.gb/3809838‑3809892 |                                                       ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:700326/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:262211/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:313110/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:321963/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:38272/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:393972/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:414237/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:449668/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:462534/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:48292/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:571404/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:659354/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:697384/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:243062/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:707296/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:750160/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:752418/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:752540/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:796929/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:807536/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:828669/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:8414/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:894647/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:904985/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:948349/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1338929/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:10586/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1078811/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:114383/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1156574/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1158417/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1184997/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1240528/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1254617/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1319256/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1320789/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1325741/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1330533/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1020157/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1342012/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1347114/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1357941/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1414915/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1451429/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1460288/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:14788/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1543979/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1568749/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:1582629/55‑1 (MQ=255) ctcGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGaaaa  <  1:235698/55‑1 (MQ=255) |                                                       CTCGGAAACCCATGCGCTGATATGTTCTGCTCCCCAGCGGGTTTGCAGAAGAAAA  >  W3110S.gb/3809838‑3809892

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑