Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3832407 3832415 9 40 [0] [0] 197 rfaQ lipopolysaccharide core biosynthesis protein

Only 100 of 197 total aligned reads displayed.

ACACCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCG  >  W3110S.gb/3832416‑3832483
|                                                                   
acatCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1521330/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAGCCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:432864/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATgcgc                            >  1:1532136/1‑42 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGctc                          >  1:958892/1‑44 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTa                        >  1:1558865/1‑46 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATaaa        >  1:582453/1‑62 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGc   >  1:55373/1‑67 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:468323/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:600674/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:551633/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:533869/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:508449/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:486639/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:483644/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:477775/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:274906/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:350552/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:287963/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:456642/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:308007/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:329045/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:417856/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:402747/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:389489/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:379678/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:369579/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:776207/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:97427/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:942309/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:921408/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:920510/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:904489/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:897127/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:880581/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:851296/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:81820/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:803103/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:791339/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:788834/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:590794/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:747826/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:691011/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:677723/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:662451/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:640086/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:640049/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:633261/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:626029/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:614004/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:606782/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:271088/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1185694/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1394101/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1367423/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:134673/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1321746/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1320401/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1308492/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1273553/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1249758/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1243583/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1235157/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1217519/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1010375/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1172046/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1135831/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1115988/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1107661/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1091929/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1084983/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1069265/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1055345/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1037299/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1027497/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1012467/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1537029/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:274422/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:246386/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:231463/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:192951/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:169289/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1591510/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1583373/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1575919/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1570429/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1562875/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1522899/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:150895/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1507267/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1504313/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1480504/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1475881/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1450766/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1435367/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1433184/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1424019/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:1422143/1‑68 (MQ=255)
acacCATCCCTAATTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:209030/1‑68 (MQ=255)
acacAATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTaa                                 >  1:1407877/1‑37 (MQ=255)
acacAATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCg  >  1:924468/1‑68 (MQ=255)
|                                                                   
ACACCATCCCTATTTTGTCTGAAAACCCGGAAATTAATGCGCTCTATGGGATAAGCAATAAAGGTGCG  >  W3110S.gb/3832416‑3832483

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑