Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3847557	3847808	252	65 [0]	[0] 54	[htrL]	[htrL]

CGCGACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATCGCAA  >  W3110S.gb/3847809‑3847866 |                                                          cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAAttt                       >  1:1523077/1‑37 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGc                     >  1:865966/1‑39 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTTGAGAATCGCaa  >  1:800413/1‑58 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAAt       >  1:919336/1‑53 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAAt       >  1:1290714/1‑53 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAAt       >  1:1066175/1‑53 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:982762/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:404250/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:414487/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:526002/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:543557/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:400079/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:549401/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:561566/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:591311/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:621706/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:635963/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:670511/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:693479/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:700912/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:709277/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:722703/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:742813/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:811232/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:874596/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:901131/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:909744/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:955120/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1008872/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1487440/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1120389/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1171145/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1181979/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1288780/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1309947/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1336080/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1356222/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1361333/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1414913/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1418569/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1426440/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1441065/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:387600/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1504530/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1574626/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1596069/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:1598469/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:160192/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:216185/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:23288/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:247150/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:281804/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:331494/1‑54 (MQ=255) cgcgACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATc      >  1:343908/1‑54 (MQ=255) |                                                          CGCGACCTATAAGTTTGGGTAATATGTGCTGGAATTTGCCCTGTCTGGAGAATCGCAA  >  W3110S.gb/3847809‑3847866

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑