Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3864097	3864220	124	43 [0]	[0] 78	yibT	hypothetical protein

GGCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGATTT  >  W3110S.gb/3864221‑3864289 |                                                                     ggCCGAAGCATGTAAAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGGTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1302865/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:569263/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:660974/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:653174/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:651527/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:646106/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:637857/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:637205/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:619139/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:592597/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:578510/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:729939/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:568639/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:567447/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:499029/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:484712/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:478219/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:461914/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:457537/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1010711/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:855152/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:976545/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:961270/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:933792/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:912259/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:888727/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:880813/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:87698/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:872626/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:430876/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:848066/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:846696/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:845646/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:838921/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:838763/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:833557/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:751700/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:737823/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:138411/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:415550/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1549804/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1491951/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:147751/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1442930/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1416778/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1414704/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1399427/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:159212/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1382209/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1340351/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1284240/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:124414/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1147796/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1146337/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1074545/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:1035544/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:321373/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:40715/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:404259/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:395434/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:394928/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:388577/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:375516/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:364844/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:362865/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:359978/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:173247/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:266895/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:249544/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:247557/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:196728/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:187178/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:186517/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:176330/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGActt  <  1:685695/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAatt  <  1:1537812/69‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGC‑TTTTTTAAGCTGAttt  <  1:733119/68‑1 (MQ=255) ggCCGAAGCAGATAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGAttt  <  1:907656/69‑1 (MQ=255) |                                                                     GGCCGAAGCAGGTAGAGGGGCAGTAAGCAGACGTTGCTTACTTTTGAAAGGCTTTTTTTAAGCTGATTT  >  W3110S.gb/3864221‑3864289

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑