Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 3920583 3920614 32 123 [0] [0] 109 cspA/yiaG major cold shock protein/predicted transcriptional regulator

Only 100 of 109 total aligned reads displayed.

CAGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGCTTA  >  W3110S.gb/3920615‑3920667
|                                                    
caGGACCGTAAACAGCAATAATGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:229760/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCGACTGctta  >  1:706390/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAAc        >  1:525006/1‑47 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:465033/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:614943/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:596420/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:586799/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:556601/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:544701/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:542334/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:513481/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:505317/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:47479/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:472792/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:63772/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:449353/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:449033/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:444414/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:437718/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:413966/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:390197/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:326200/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:320451/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:317548/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:309007/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:302422/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:798732/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:964659/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:955292/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:901521/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:877479/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:870236/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:868297/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:853817/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:843902/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:817471/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:802646/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:801311/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:800864/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:637351/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:79647/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:784438/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:762776/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:732762/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:728532/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:716968/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:711491/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:694311/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:652989/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:651940/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:300380/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1213873/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1367646/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1367519/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1314230/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1310973/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1307559/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1307206/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1303190/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1298412/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1274274/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1238928/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1232697/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1214750/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1395442/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1200337/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1155985/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1153271/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1116215/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1105991/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1103598/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1102716/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1096630/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:108979/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1069081/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1029430/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1601303/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:294925/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:292027/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:285905/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:262050/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:255855/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:22034/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:213973/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:212160/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:203880/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:201207/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:199713/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:101070/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1586907/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1571017/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1570063/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:150138/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1495326/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1494237/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1467215/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1463624/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  >  1:1402286/1‑53 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1401441/53‑1 (MQ=255)
caGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGctta  <  1:1400269/53‑1 (MQ=255)
|                                                    
CAGGACCGTAAACAGCAATAAAGTGGATAAAAGTCTATTCCATCAACTGCTTA  >  W3110S.gb/3920615‑3920667

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑