Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3961448	3961674	227	161 [0]	[0] 39	yhjH	EAL domain containing protein involved in flagellar function

TGTGTGAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAA  >  W3110S.gb/3961675‑3961740 |                                                                  tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGTGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:780232/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:689026/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1176007/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:276358/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:357345/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:369609/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:407656/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:518533/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:568185/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:570002/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:583018/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:253981/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:715671/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:718770/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:78985/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:804380/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:810351/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:857048/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:988796/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1481991/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1191561/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1205559/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1221473/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1323602/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1327520/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1334039/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1361717/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1464820/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:222619/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1487916/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1552642/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1556371/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:156230/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1564371/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:1574631/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:17967/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTaa  >  1:190563/1‑66 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTa   >  1:825757/1‑65 (MQ=255) tgtgtgAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTa   >  1:301370/1‑65 (MQ=255) |                                                                  TGTGTGAATTTGGCCCGCTGTGGCTGGATGATTTTGGTACCGGGATGGCAAATTTCTCTGCGCTAA  >  W3110S.gb/3961675‑3961740

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑