Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3970852	3971041	190	111 [0]	[0] 36	treF/yhjA	cytoplasmic trehalase/predicted cytochrome C peroxidase

ATGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTG  >  W3110S.gb/3971042‑3971110 |                                                                     atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:600843/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:414662/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:425593/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:456604/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:472926/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:474680/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:494180/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:542899/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:569175/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:348234/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:626871/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:743817/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:815961/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:836243/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:860655/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:893712/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:909936/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:970715/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:1445100/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:1069363/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:1084914/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:1174066/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:1236228/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:1282173/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:1284035/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:1288979/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:142956/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:1022584/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:1484904/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:1494643/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:221321/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:244318/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:288170/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:322889/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:339723/69‑1 (MQ=255) atGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAattgattg  <  1:348022/69‑1 (MQ=255) |                                                                     ATGCCATTCCTGATCTGGGTAATAGGCACAGGCTATCTTATTGATAGTTTATATTCATGTAATTGATTG  >  W3110S.gb/3971042‑3971110

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑