Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3982312	3982328	17	215 [0]	[0] 40	gadE/hdeD	DNA‑binding transcriptional activator/acid‑resistance membrane protein

TGTGATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCG  >  W3110S.gb/3982329‑3982397 |                                                                     tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGtc             >  1:1228008/1‑58 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGtc             >  1:360144/1‑58 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGttt    >  1:1180518/1‑67 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGttt    >  1:1362517/1‑67 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGt      >  1:523949/1‑65 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:410820/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:219587/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:263653/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:264932/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:272393/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:291299/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:730114/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:775976/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:415376/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:45102/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:505260/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:673926/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:161793/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:1519875/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:814245/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:1371901/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:1362087/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:13614/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:86803/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:1262345/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:1241985/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTc   >  1:1003358/1‑68 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCg  >  1:952783/1‑69 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCg  >  1:758853/1‑69 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCg  >  1:882032/1‑69 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCg  >  1:918829/1‑69 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCg  >  1:715322/1‑69 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCg  >  1:39578/1‑69 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCg  >  1:374098/1‑69 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCg  >  1:1584154/1‑69 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCg  >  1:1450947/1‑69 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCg  >  1:1332327/1‑69 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCg  >  1:1316049/1‑69 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCg  >  1:1312559/1‑69 (MQ=255) tgtgATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCg  >  1:1018820/1‑69 (MQ=255) |                                                                     TGTGATCTCTGAAGAATATTACTAAAGTTAAAATGTAATCCGATTTAAATATCGAGTCTCCTTGTTTCG  >  W3110S.gb/3982329‑3982397

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑