Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4007357 4007395 39 54 [0] [1] 188 yhiK ECK3474:JW5674:b3489; hypothetical protein

Only 100 of 188 total aligned reads displayed.

GAAGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAT  >  W3110S.gb/4007395‑4007464
 |                                                                    
gAAGACCCCAGCAAATACATTAGAC‑AAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:305801/69‑1 (MQ=255)
 aaGTCCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1392802/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:40282/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:636522/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:614517/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:595242/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:554261/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:550239/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:512223/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:494692/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:488358/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:480179/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:456018/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:428515/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:653564/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:399754/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:389318/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:372758/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:370446/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:345299/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:299098/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:291793/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:285284/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:233550/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:230481/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:821290/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:975855/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:970839/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:946422/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:944056/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:931599/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:904229/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:897957/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:886699/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:881098/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:866438/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:86160/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:841566/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:228382/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:808328/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:789577/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:770510/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:764288/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:745512/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:742045/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:734652/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:71818/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:701328/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:688741/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:665646/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1167479/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1340623/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1323426/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1313330/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1301131/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1294624/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:126579/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1260897/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1241927/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1236710/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1231541/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1206020/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1172013/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:137764/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1163515/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1161191/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1158294/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1157457/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1094507/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1075499/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1061381/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1048534/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1040459/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1025631/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1004074/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1527545/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:211571/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:208155/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:191231/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:171947/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:167432/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1607018/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1599665/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1594371/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1587015/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1559040/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1546939/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1538162/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:100352/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1524017/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1515585/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1508848/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1504914/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1461952/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1454613/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1441139/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1425918/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:140454/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAt  <  1:1384386/69‑1 (MQ=255)
 aaGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATAAACAAt  <  1:57601/69‑1 (MQ=255)
 |                                                                    
GAAGACCCCAGCAAATACATTAGACAAAAATATGGGCATCATGGGCCCGGGGTAGATCATAATCAACAAT  >  W3110S.gb/4007395‑4007464

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑