Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4009279	4009350	72	56 [0]	[0] 32	yhiJ	hypothetical protein

GGGCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCT  >  W3110S.gb/4009351‑4009416 |                                                                  gggCCTGAGATAACCCCTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:352778/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTa       >  1:657787/1‑61 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGcc   >  1:312111/1‑65 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1571033/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:906733/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:866980/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:857313/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:836873/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:765865/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:41082/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:358074/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:333207/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:301632/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:299814/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:268162/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1011858/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1563641/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1559537/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1484363/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1391415/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1390170/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1312087/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1161201/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1147342/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1097793/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:108623/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1069732/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1026506/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1025815/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1012286/1‑66 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATG‑AAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:1032180/1‑65 (MQ=255) gggCCTGAGATAACCACTCCCT‑‑AAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCt  >  1:894849/1‑64 (MQ=255) |                                                                  GGGCCTGAGATAACCACTCCCTGGAAGTCTTACCAGCATGAAAAAAACAGAAATGGACTTATGCCT  >  W3110S.gb/4009351‑4009416

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑