Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4042771	4043640	870	220 [0]	[0] 68	[livK]	[livK]

ATGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCG  >  W3110S.gb/4043641‑4043709 |                                                                     aTGCTGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1071242/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGCCCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1341066/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGTCATCg  <  1:1431311/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:543216/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:697226/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:67493/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:662014/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:637277/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:633393/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:615142/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:609120/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:706177/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:540378/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:531759/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:517077/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:433835/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:366990/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:359824/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:315436/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:304864/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:252291/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:706738/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:728608/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:742693/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:778255/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:860542/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:864580/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:87137/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:875360/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:928007/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:938042/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:950570/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:95138/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:954643/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:97993/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:983105/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1394310/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1005504/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1019235/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:102953/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1032923/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1044980/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:107444/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1076858/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:10814/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1090339/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1097436/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:112081/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1167484/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1212613/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1255167/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1268659/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:26576/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:145012/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1455325/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1492196/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1506878/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1529158/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1530662/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1533864/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1552697/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1568527/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1579609/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:183797/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:184975/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:231131/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:233864/69‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCg  <  1:1003573/69‑1 (MQ=255) |                                                                     ATGCCGCCGAAGGCATGTTGGTCACTATGCCAAAACGCTATGACCAGGATCCGGCAAACCAGGGCATCG  >  W3110S.gb/4043641‑4043709

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑