Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4069456	4069500	45	74 [0]	[0] 89	glgX	glycogen debranching enzyme

ACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATG  >  W3110S.gb/4069501‑4069569 |                                                                     aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:328742/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:507653/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:492278/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:472715/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:469591/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:468533/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:410952/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:398569/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:395293/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:376278/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:344418/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:516340/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:30701/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:288848/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:262837/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:215169/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:16660/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1602839/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1600634/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1584179/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:156765/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1557459/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:818077/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:99948/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:95680/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:938805/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:917826/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:91479/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:884854/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:866590/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:862381/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:83110/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:823126/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1549588/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:772388/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:712632/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:704623/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:697171/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:690190/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:670876/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:593341/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:589701/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:540589/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:530446/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1114475/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1264539/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1240897/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1211168/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1210954/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1210102/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1142459/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1137119/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1136571/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1117714/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1114595/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1290406/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:110810/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:110696/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1100555/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1097260/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1095619/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1087130/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1068765/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1058794/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1021025/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1014767/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1409539/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1533100/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1527469/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1479921/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1475416/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1464127/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:144605/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1428610/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1425562/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1001158/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1382049/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:137587/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1367296/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1354781/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1353792/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1334564/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1318140/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1314347/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1304924/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1296118/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATCAAGCCCATg  <  1:1414835/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGGGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:284993/69‑1 (MQ=255) aCTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGGGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATg  <  1:1046826/69‑1 (MQ=255) |                                                                     ACTATGACTGGGAAGATGATGCCCCGCCGCGCACGCCGTGGGGCAGCACCATCATTTATGAAGCCCATG  >  W3110S.gb/4069501‑4069569

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑