Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb790,2942.T60.8% 706.4 / inf 339coding (108/1149 nt)galKgalactokinase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base . (0/133);  new base T (0/206);  total (0/339)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.80e-01
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold.

Only 100 of 340 total aligned reads displayed.

CAGAACGAAACCGTCGTTGTAGTCG‑‑GTGTGTTCACCAATCAAATTCACGCGGCCAGGCGCCTGAATGGTGTG  >  W3110S.gb/790270‑790341
                          |                                               
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              cgtTGTAGTCGGTGTGTGTTCACCAATCAAATTCACGCGGCCAGGCGCCTGAATGGtgtg  <  1:1293998/60‑1 (MQ=255)
                        g‑‑gTGTGTTCACCAATCAAATTCACGCGGCCAGGCGCCTGAATGgt     <  1:818164/45‑1 (MQ=255)
                          |                                               
CAGAACGAAACCGTCGTTGTAGTCG‑‑GTGTGTTCACCAATCAAATTCACGCGGCCAGGCGCCTGAATGGTGTG  >  W3110S.gb/790270‑790341

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑