Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 70,244 T→C intergenic (‑196/‑143) araB ← / → araC L‑ribulokinase/DNA‑binding transcriptional dual regulator

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb70,2440TC100.0% 281.7 / NA 76intergenic (‑196/‑143)araB/araCL‑ribulokinase/DNA‑binding transcriptional dual regulator
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (76/0);  total (76/0)

GCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCGAG  >  W3110S.gb/70237‑70299
       |                                                       
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTAcc                 >  1:580111/1‑48 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTggg          >  1:219560/1‑55 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:578278/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:729174/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:728481/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:715204/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:714979/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:654834/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:653506/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:647730/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:62434/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:742680/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:527489/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:526108/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:508443/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:502297/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:427453/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:417305/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1007971/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:928471/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:996133/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:970184/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:965095/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:936795/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:935845/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:933271/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:931007/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:930542/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:361901/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:918752/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:906718/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:882162/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:873947/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:855617/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:821941/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:751351/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:747347/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1157055/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1411666/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1375251/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1353248/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1347819/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1344518/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1285515/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1181896/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1181631/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:327902/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1098712/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1097837/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1072515/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1058403/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1044111/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1039417/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1026479/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:100985/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1533185/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:355041/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:324767/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:293342/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:278510/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:270063/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:248639/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1572068/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1417170/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1526602/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:152270/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1510797/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1503222/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1502047/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:1468420/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCga   >  1:1129383/1‑62 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCga   >  1:1414294/1‑62 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGATGGGt         >  1:788147/1‑56 (MQ=255)
gCTTTGGCCCCGCTTTGCTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:694804/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGCCCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:207590/1‑63 (MQ=255)
gCTTTGACCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCgag  >  1:3977/1‑63 (MQ=255)
       |                                                       
GCTTTGGTCCCGCTTTGTTACAGAATGCTTTTAATAAGCGGGGTTACCGGTTGGGTTAGCGAG  >  W3110S.gb/70237‑70299

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑