Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,620,710 C→T intergenic (‑88/‑124) marC ← / → marR predicted transporter/DNA‑binding transcriptional repressor

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,620,7100CT100.0% 281.6 / NA 76intergenic (‑88/‑124)marC/marRpredicted transporter/DNA‑binding transcriptional repressor
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (76/0);  total (76/0)

TAGCTAGCCTTGCATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAATTCA  >  W3110S.gb/1620698‑1620765
            |                                                       
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTa                           >  1:173261/1‑43 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCaaaa                     >  1:675688/1‑49 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCaaaa                     >  1:1396232/1‑49 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:590534/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:673626/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:672826/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:665539/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:662880/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:629626/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:602462/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:595878/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:696869/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:546377/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:534674/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:532866/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:511965/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:49404/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:466028/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:432386/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:356567/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:335874/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:842310/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:970881/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:95683/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:947827/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:943722/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:941832/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:887830/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:885309/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:842537/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:31443/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:838973/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:820188/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:816045/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:800371/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:800198/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:778565/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:767625/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:705263/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1257634/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:332210/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1397122/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1386412/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1365111/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1364311/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:130964/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1275065/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1263580/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1402881/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1251288/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1227452/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1199703/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1169181/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:116565/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1150808/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1100922/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1068980/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:213860/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1045206/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:305571/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:271615/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:265487/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:260758/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:232646/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:23121/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:222900/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1444605/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:185278/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1604957/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1579476/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1562403/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1549288/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1502616/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattca  >  1:1474051/1‑68 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattc   >  1:111942/1‑67 (MQ=255)
tagctagcCTTGTATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAattc   >  1:1386438/1‑67 (MQ=255)
            |                                                       
TAGCTAGCCTTGCATCGCATTGAACAAAACTTGAACCGATTTAGCAAAACGTGGCATCGGTCAATTCA  >  W3110S.gb/1620698‑1620765

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: