Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 1,965,064 G→A I567I (ATC→ATT)  flhA ← predicted flagellar export pore protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb1,965,0640GA100.0% 756.7 / NA 203I567I (ATC→ATT) flhApredicted flagellar export pore protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  new base A (203/0);  total (203/0)

Only 100 of 203 total aligned reads displayed.

TAATCGCCCGTCCCAACGCCACGCGCACGACGGCGGTTAATTCATGTGGATCGCTTTGGATGGGCGCAT  >  W3110S.gb/1965006‑1965074
                                                          |          
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                                                          |          
TAATCGCCCGTCCCAACGCCACGCGCACGACGGCGGTTAATTCATGTGGATCGCTTTGGATGGGCGCAT  >  W3110S.gb/1965006‑1965074

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑