Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 198,971 C→T Y348Y (TAC→TAT yaeT → conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb198,9710CT100.0% 1095.8 / NA 291Y348Y (TAC→TATyaeTconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (291/0);  total (291/0)

Only 100 of 291 total aligned reads displayed.

TCTACGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGC  >  W3110S.gb/198967‑199035
    |                                                                
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCt                                >  1:1550502/1‑39 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCt                                >  1:282817/1‑39 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGaaa                           >  1:557065/1‑44 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTg               >  1:75201/1‑56 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTg               >  1:501898/1‑56 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCTTCGCGAAATGc  >  1:794870/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTTGCGAAATGc  >  1:969573/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGaa      >  1:464392/1‑65 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATg   >  1:1409430/1‑68 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATg   >  1:1326221/1‑68 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATg   >  1:1591928/1‑68 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATg   >  1:1024612/1‑68 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:400167/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:642093/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:602938/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:592899/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:582981/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:570833/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:375438/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:540131/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:472050/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:532068/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:404283/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:411607/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:516629/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:430735/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:434239/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:494803/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:48615/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:80872/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:980488/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:963133/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:946855/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:91279/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:902519/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:879800/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:864661/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:847533/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:841346/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:832943/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:814279/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:619714/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:76588/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:734354/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:729507/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:713236/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:698609/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:682303/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:67183/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:660101/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:30352/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:627008/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1197729/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:337647/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1344318/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1337493/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:133678/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1322541/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1304287/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1281533/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1246573/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1227411/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1217961/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1206031/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1379106/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:117845/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1174074/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1152267/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1123990/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1108448/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1102835/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1088074/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1082225/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1048718/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1043724/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1019557/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1606567/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:31734/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1009847/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:294344/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:271920/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:267450/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:257055/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:241942/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:231119/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:193747/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:182559/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1383117/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:159857/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1582656/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1521363/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1507493/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1505026/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1471223/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1448337/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1431888/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1395918/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:1393181/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGACCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:927299/1‑69 (MQ=255)
tCTATGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCAGTCCTGCGTCGCGAAATGc  >  1:511679/1‑69 (MQ=255)
    |                                                                
TCTACGTGCGTAAGATCCGTTTTGAAGGTAACGATACCTCGAAAGATGCCGTCCTGCGTCGCGAAATGC  >  W3110S.gb/198967‑199035

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: