Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,824,280 T→C pseudogene (413/687 nt) rph → ECK3633:JW3618:b3643; ribonuclease PH

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,824,2800TC100.0% 352.7 / NA 96pseudogene (413/687 nt)rphECK3633:JW3618:b3643; ribonuclease PH
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (0/96);  total (0/96)

GGCACGCGTACCGCGTCGATTACGGGTGCCTGCGTGGCGCTGGTAGATGCGCTACAGAAGCTGGTGGAA  >  W3110S.gb/3824237‑3824305
                                           |                         
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                                           |                         
GGCACGCGTACCGCGTCGATTACGGGTGCCTGCGTGGCGCTGGTAGATGCGCTACAGAAGCTGGTGGAA  >  W3110S.gb/3824237‑3824305

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑