Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,591,459 G→A S13S (AGC→AGT)  hsdR ← endonuclease R

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,591,4590GA99.5% 800.5 / NA 217S13S (AGC→AGT) hsdRendonuclease R
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  major base A (216/0);  minor base T (1/0);  total (217/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 217 total aligned reads displayed.

AGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCT  >  W3110S.gb/4591393‑4591461
                                                                  |  
aGTGAAGTCGTTGCCGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1334079/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGCCGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:864146/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGTTTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1469368/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTGATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:108146/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:398509/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:553584/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:549893/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:537764/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:531735/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:517617/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:506709/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:496692/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:475913/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:442754/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:416851/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:409731/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:638051/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:383159/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:368406/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:339225/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:328463/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:300387/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:283006/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:274021/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:268502/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:250745/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:231239/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:840999/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:980781/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:969304/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:960576/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:955009/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:941826/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:911132/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:89724/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:892461/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:884723/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:879839/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:853392/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:571912/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:827889/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:80106/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:797163/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:769945/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:757946/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:746655/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:697799/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:688947/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:675524/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:641142/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:199829/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1117740/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1019131/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1230243/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1223523/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1212408/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1211813/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1183167/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1168440/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1157746/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1149253/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1126780/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1122791/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1284011/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1109693/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1107362/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1092106/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1090216/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1078039/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1066107/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1061438/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1046029/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1037088/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1032169/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1029173/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1461802/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:193937/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:183310/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:168206/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1599952/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1580228/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1569775/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1552256/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1540178/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1517595/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1499397/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1495119/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1480121/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1309981/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1438915/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1417610/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1400159/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:138960/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1375682/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:135424/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1340644/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1326319/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:1321886/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATACATTACt  >  1:663362/1‑69 (MQ=255)
aGTGAAGACGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTACt  >  1:822657/1‑69 (MQ=255)
                                                                  |  
AGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCT  >  W3110S.gb/4591393‑4591461

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑