| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 2,829,103 | T→C | 7.5% | V212A (GTG→GCG) | gutQ → | predicted phosphosugar‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 2,829,103 | 0 | T | C | 7.5% | 175.8 / 6.1 | 67 | V212A (GTG→GCG) | gutQ | predicted phosphosugar‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/26); new base C (2/3); total (38/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.40e-01 | |||||||||||
GGGCACTGGGCGCTCGCTTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTA > W3110S.gb/2829034‑2829173 | gggCACTGGGCGCTCGCTTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTg < 1:3266824/71‑1 (MQ=255) ggCACTGGGCGCTCGCTTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTgg > 1:2885209/1‑71 (MQ=255) ggCACTGGGCGCTCGCTTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTgg < 1:3807638/71‑1 (MQ=255) ggCACTGGGCGCTCGCTTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTg > 1:327546/1‑70 (MQ=255) tGGGCGCTCGCTTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGtt > 1:833568/1‑70 (MQ=255) gggCGCTCGCTTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTaa > 1:4297322/1‑71 (MQ=255) gggCGCTCGCTTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTa > 1:2424416/1‑70 (MQ=255) ggCGCTCGCTTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTa < 1:76346/69‑1 (MQ=255) gcgcTCGCTTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAAcc > 1:4487908/1‑71 (MQ=255) gctcgctTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGc < 1:2811447/71‑1 (MQ=255) gctcgctTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGc < 1:1082614/71‑1 (MQ=255) tcgctTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTa < 1:3625197/64‑1 (MQ=255) tcgctTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGc > 1:585329/1‑69 (MQ=255) cgctTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAg > 1:2752376/1‑71 (MQ=255) gctTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGc > 1:3235935/1‑71 (MQ=255) gCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGt < 1:3854077/69‑1 (MQ=255) gCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGt < 1:1324851/69‑1 (MQ=255) cTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTgat < 1:1216089/71‑1 (MQ=255) aTAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGt > 1:4008626/1‑51 (MQ=255) aTAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGt > 1:3350173/1‑51 (MQ=255) tAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTga > 1:770605/1‑65 (MQ=255) aaaGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGCGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGgatgc > 1:427738/1‑71 (MQ=255) aGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGCGGCGTTAACCGc > 1:2741373/1‑54 (MQ=255) gTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTgatgga > 1:1976045/1‑65 (MQ=255) catcatCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCt < 1:57854/71‑1 (MQ=255) tcatcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTa < 1:3122352/43‑1 (MQ=255) tcatcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTg > 1:2344149/1‑70 (MQ=255) atcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCg > 1:2747687/1‑38 (MQ=255) atcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAAcc > 1:394/1‑44 (MQ=255) atcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAAcc > 1:3951345/1‑44 (MQ=255) atcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAAc > 1:2136185/1‑43 (MQ=255) atcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGt < 1:1751122/52‑1 (MQ=255) atcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTgatgg > 1:2711574/1‑57 (MQ=255) atcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTgatgg > 1:4192919/1‑57 (MQ=255) atcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGaa > 1:3632851/1‑71 (MQ=255) tcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGtt < 1:3922208/39‑1 (MQ=255) tcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGtt < 1:2854086/39‑1 (MQ=255) tcTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAAc > 1:3079609/1‑71 (MQ=255) cTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTaa > 1:1859222/1‑40 (MQ=255) tGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCGGCGTgat > 1:3652008/1‑52 (MQ=255) tGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACt > 1:2313813/1‑70 (MQ=255) aTGCGCCGTTACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGGGATGGATGCGATGCTGGAACTCAg < 1:3630970/71‑1 (MQ=255) aTGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCa < 1:3896247/70‑1 (MQ=255) cgcCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAAc < 1:3098905/64‑1 (MQ=255) cgcCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAAc < 1:1379180/64‑1 (MQ=255) cgcCGTGACGATGCCATCCCACAGGCGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGcc < 1:352480/70‑1 (MQ=255) tGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCg < 1:1324297/71‑1 (MQ=255) aCGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCgg > 1:4561563/1‑70 (MQ=255) aCGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGt > 1:3833675/1‑71 (MQ=255) aCGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGt > 1:4499956/1‑71 (MQ=255) aCGATGACATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGt > 1:8771/1‑71 (MQ=255) gATGCCATCCCACAGGCGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCt < 1:2522530/71‑1 (MQ=255) aTGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTg < 1:880982/71‑1 (MQ=255) tGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTgg > 1:963566/1‑71 (MQ=255) tGCCATCCCACAGGCGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCt < 1:1031417/69‑1 (MQ=255) aTCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCt < 1:3055783/71‑1 (MQ=255) cccACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAAc > 1:3860749/1‑47 (MQ=255) cccACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCtg > 1:2954332/1‑70 (MQ=255) ccACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGc > 1:4389059/1‑51 (MQ=255) caGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGc > 1:1837444/1‑71 (MQ=255) ggTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGaa > 1:4627831/1‑40 (MQ=255) ggTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTc > 1:3584058/1‑56 (MQ=255) gTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCt < 1:4450338/56‑1 (MQ=255) gTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCgg < 1:584460/70‑1 (MQ=255) gTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGt < 1:3103462/71‑1 (MQ=255) gTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGt < 1:3572035/71‑1 (MQ=255) gTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGGCt < 1:2917068/56‑1 (MQ=255) tGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTa < 1:2744356/71‑1 (MQ=255) | GGGCACTGGGCGCTCGCTTGCTGAATAAAGTGCATCATCTGATGCGCCGTGACGATGCCATCCCACAGGTGGCGTTAACCGCCAGCGTGATGGATGCGATGCTGGAACTCAGCCGCACCGGTCTGGGGCTGGTGGCGGTA > W3110S.gb/2829034‑2829173 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |