Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	2073813	2073832	20	9 [0]	[0] 4	flu	antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter

CCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGTGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCAC  >  W3110S.gb/2073743‑2073812                                                                      | ccTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGTGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAgtcac  <  1:1108003/70‑1 (MQ=255) ccTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGTGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAgtcac  <  1:1652671/70‑1 (MQ=255) ccTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGTGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAgtcac  <  1:1895443/70‑1 (MQ=255) ccTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGTGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAgtcac  <  1:2324623/70‑1 (MQ=255) ccTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGTGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAgtcac  <  1:2353801/70‑1 (MQ=255) ccTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGTGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAgtcac  <  1:2651565/70‑1 (MQ=255) ccTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGTGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAgtcac  <  1:760750/70‑1 (MQ=255) ccTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGTGGGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAgtcac  <  1:2756777/70‑1 (MQ=255)                          tAAACGTGGCGGTGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAgtcac  <  1:221424/45‑1 (MQ=255)                                                                      | CCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGTGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCAC  >  W3110S.gb/2073743‑2073812

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑