Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	3,626,660	G→T	21.2%	L284L (CTC→CTA)	pldB ←	lysophospholipase L(2)

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	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	3,626,660	0	G	T	21.2%	82.3 / 11.1	33	L284L (CTC→CTA)	pldB	lysophospholipase L(2)
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (22/4);  new base T (5/2);  total (27/6)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.84e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01

TAAGCACCTTTAATTACCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCACGCGTTCC  >  W3110S.gb/3626601‑3626705                                                            |                                              tAAGCACCTTTAATTACCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGTATGGCCCGCGGCGGTGCGGAg                                             >  1:3093128/1‑62 (MQ=255) tAAGCACCTTTAATTACCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACaaa                                     >  1:2430131/1‑70 (MQ=255) tAAGCACCTTTAATTACCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACaaa                                     >  1:1548012/1‑70 (MQ=255) tAAGCACCTTTAATTACCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCACGCGGCGGTGCGGAGTTCACaaa                                     >  1:2744136/1‑70 (MQ=255) tAAGCACCTTAAATTACCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGtt                                           >  1:2811200/1‑64 (MQ=255)           tAATTACCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTcatg                           >  1:3264298/1‑70 (MQ=255)           tAATTACCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTcatg                           >  1:1750004/1‑70 (MQ=255)           tAATTACCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTcatg                           >  1:208371/1‑70 (MQ=255)           tAATTACCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTcatg                           >  1:2337381/1‑70 (MQ=255)              ttACCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTcatgcatg                       <  1:1287664/71‑1 (MQ=255)              ttACCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCAGCGGTGCGTAGTTCACAAAAACGGt                               <  1:1137542/63‑1 (MQ=255)              ttACCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCAGCGGTGCGTAGTTCACAAAAACGGt                               <  1:1960952/63‑1 (MQ=255)                aCCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCAGCGGTGCGTAGTTCACAAAAACGGTcg                             >  1:1324743/1‑62 (MQ=255)                aCCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCAGCGGTGCGTAGTTCACAAAAACGGTcg                             >  1:3237583/1‑62 (MQ=255)                aCCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCAGCGGTGCGTAGTTCACAAAAACGGTcg                             >  1:307009/1‑62 (MQ=255)                aCCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCAGCGGTGCGTAGTTCACAAAAACGGTcg                             >  1:55273/1‑62 (MQ=255)                aCCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCAGCGGTGCGTAGTTCACAAAAACGGTc                              >  1:1343475/1‑62 (MQ=255)                             ctcctTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCcaccac         >  1:3293937/1‑70 (MQ=255)                             ctcctTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCAcg        >  1:2957928/1‑71 (MQ=255)                             ctcctTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCAcg        >  1:286097/1‑71 (MQ=255)                             ctcctTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCAcg        >  1:1075162/1‑71 (MQ=255)                             ctcctTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCAcg        >  1:2852289/1‑71 (MQ=255)                             ctcctTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCAcg        >  1:2430575/1‑71 (MQ=255)                             ctcctTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCAcg        >  1:2144821/1‑71 (MQ=255)                             ctcctTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCAcg        >  1:1805031/1‑71 (MQ=255)                             ctcctTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCAcg        >  1:1559007/1‑71 (MQ=255)                             ctcctTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCAcg        >  1:1355651/1‑71 (MQ=255)                             ctcctTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCAcg        >  1:1205367/1‑71 (MQ=255)                             ctcctTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCAcg        >  1:1105774/1‑71 (MQ=255)                             ctcctTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCAcg        >  1:1069537/1‑71 (MQ=255)                                    gACAGGATGGCCCTCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCACGCGTTcc  <  1:848306/70‑1 (MQ=255)                                    gACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCACGCGTTcc  <  1:2879872/70‑1 (MQ=255)                                    gACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCACGCGTTcc  <  1:503081/70‑1 (MQ=255)                                                            |                                              TAAGCACCTTTAATTACCAACGGCCGTCCTCCTTCGACAGGATGGCCCGCGGCGGTGCGGAGTTCACAAAAACGGTCATGCATGCGGTTATCCACCACGCGTTCC  >  W3110S.gb/3626601‑3626705

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑