| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 922,060 | C→T | 18.3% | A431V (GCC→GTC) | macB → | fused macrolide transporter subunits and ATP‑binding component and membrane component of ABC superfamily |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 922,060 | 0 | C | T | 18.3% | 140.9 / 22.3 | 60 | A431V (GCC→GTC) | macB | fused macrolide transporter subunits and ATP‑binding component and membrane component of ABC superfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (25/24); new base T (4/7); total (29/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.09e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTA > W3110S.gb/921991‑922130 | cTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGATGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGc > 1:2417245/1‑70 (MQ=255)cTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGc > 1:3428657/1‑70 (MQ=255)cTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGc > 1:364449/1‑70 (MQ=255)cTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGc > 1:1349983/1‑70 (MQ=255)cTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGc > 1:2428860/1‑70 (MQ=255)cTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGc > 1:796078/1‑70 (MQ=255) gccgccAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCa > 1:638012/1‑69 (MQ=255) gccgccAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCa > 1:3199301/1‑69 (MQ=255) aGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGTCAGAGTCAt > 1:460540/1‑70 (MQ=255) aGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGTCAGAGTCAt > 1:1820359/1‑70 (MQ=255) aGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCAtt < 1:567964/71‑1 (MQ=255) cTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTgg < 1:382028/71‑1 (MQ=255) aTAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGTCAGAGTCATTGGTGTGGCgg > 1:4021684/1‑69 (MQ=255) aaGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGTCAGAGTCATTGGTGTGGCGgaaga > 1:1670817/1‑70 (MQ=255) gCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGaaa > 1:3334677/1‑70 (MQ=255) ttGGGGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATg < 1:3531227/71‑1 (MQ=255) ttGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCTCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGATGAAAAACAGTCGATg < 1:1023582/71‑1 (MQ=255) ggCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGtt > 1:2125638/1‑71 (MQ=255) ggCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGtt > 1:3898008/1‑71 (MQ=255) gCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTgg < 1:1927004/43‑1 (MQ=255) gAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTgg < 1:3158789/71‑1 (MQ=255) gAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTgg < 1:2218184/71‑1 (MQ=255) ggTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTgg > 1:3940366/1‑69 (MQ=255) ggTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTgg > 1:2193511/1‑69 (MQ=255) aTTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATg < 1:1593969/60‑1 (MQ=255) ttCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGaaa < 1:2318055/48‑1 (MQ=255) ttCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGaaa < 1:3780950/48‑1 (MQ=255) ttCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGaaa < 1:3567146/48‑1 (MQ=255) tCTGGTCGTCAATATGCCCGTCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTa < 1:1007373/65‑1 (MQ=255) tCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGt > 1:967738/1‑70 (MQ=255) cTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGaaaaa > 1:3539547/1‑48 (MQ=255) cTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGaaaaa > 1:319464/1‑48 (MQ=255) cTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTTGATGTTTGGTAGCAGTa > 1:4021634/1‑70 (MQ=255) cTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTa > 1:285368/1‑70 (MQ=255) cTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTa > 1:2944807/1‑70 (MQ=255) cTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTa > 1:1961425/1‑70 (MQ=255) cTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTa < 1:1580136/70‑1 (MQ=255) tGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTgg < 1:4028401/61‑1 (MQ=255) tGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTgg < 1:2909205/61‑1 (MQ=255) gTCGGCAATATGCGCGTCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTATAGt < 1:402873/71‑1 (MQ=255) gTCGGCAATATGCCCGTCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGt < 1:2394691/71‑1 (MQ=255) gTCGGCAATATGCCCGTCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGt < 1:892995/71‑1 (MQ=255) cAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAg < 1:745992/43‑1 (MQ=255) cAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAg < 1:214002/43‑1 (MQ=255) atatGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGAt < 1:1039796/46‑1 (MQ=255) atatGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTa < 1:3961003/60‑1 (MQ=255) atatGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTa < 1:3465279/60‑1 (MQ=255) atatGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTa < 1:1901120/60‑1 (MQ=255) atatGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTa < 1:3416616/60‑1 (MQ=255) tatGCCCGTCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCgtg < 1:2612312/71‑1 (MQ=255) tatGCCCGTCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCgtg < 1:3353903/71‑1 (MQ=255) tatGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGaaaaa > 1:2965529/1‑37 (MQ=255) tatGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGaaaaa > 1:2154788/1‑37 (MQ=255) tatGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGaaaaa < 1:1454858/37‑1 (MQ=255) tatGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGaaaaa > 1:1282479/1‑37 (MQ=255) tatGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACa < 1:2736339/39‑1 (MQ=255) tatGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTa < 1:943677/59‑1 (MQ=255) atGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGt > 1:3519700/1‑46 (MQ=255) atGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGt > 1:2046895/1‑46 (MQ=255) atGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTATAGTGCTGCgtgt > 1:1015349/1‑71 (MQ=255) atGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCgtgt > 1:711258/1‑71 (MQ=255) atGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCg > 1:706242/1‑68 (MQ=255) tggccGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTc > 1:2747991/4‑71 (MQ=255) tGCCCGTCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTc < 1:2199108/71‑1 (MQ=255) tGCCCGCCAGAGTCATTTGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGa > 1:871357/1‑42 (MQ=255) tGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGa > 1:2748895/1‑42 (MQ=255) ccAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTa < 1:3045971/71‑1 (MQ=255) | CTCGCCGCCAGCTTTTCCCCCATAAAGCAGATGTGGTTGGCGAGGTGATTCTGGTCGGCAATATGCCCGCCAGAGTCATTGGTGTGGCGGAAGAAAAACAGTCGATGTTTGGTAGCAGTAAAGTGCTGCGTGTCTGGCTA > W3110S.gb/921991‑922130 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |