| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 90,917 | T→C | 57.0% | T291T (ACT→ACC) | ftsZ → | GTP‑binding tubulin‑like cell division protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 90,917 | 0 | T | C | 57.0% | 19.0 / 46.0 | 65 | T291T (ACT→ACC) | ftsZ | GTP‑binding tubulin‑like cell division protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (12/16); new base C (13/24); total (25/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.07e-01 | |||||||||||
TCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGC > minE/90868‑90979 | tCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTtctc < 1:86790/69‑1 (MQ=255)tCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTtctc < 1:3274632/69‑1 (MQ=255) cGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTAt > 1:340770/1‑57 (MQ=255) cGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATc > 1:2669205/1‑58 (MQ=255) cGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATc > 1:776773/1‑58 (MQ=255) cGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATc > 1:71182/1‑58 (MQ=255) cGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATc > 1:444187/1‑58 (MQ=255) cGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATc > 1:3386032/1‑58 (MQ=255) cGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATc > 1:3348100/1‑58 (MQ=255) cGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATc > 1:3200143/1‑58 (MQ=255) cGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATc > 1:2413364/1‑58 (MQ=255) cGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATc > 1:2185895/1‑58 (MQ=255) cGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATc > 1:2114612/1‑58 (MQ=255) cGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATc > 1:1628342/1‑58 (MQ=255) cGAAACGATAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATc > 1:2621423/1‑58 (MQ=255) aaCGGTAGGTAACACCAACCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGGACTTCTCTTg < 1:1396625/68‑1 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTg < 1:1403157/55‑1 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTg < 1:1286550/55‑1 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTg < 1:724297/55‑1 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTg < 1:545552/55‑1 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTg < 1:1479979/55‑1 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTg < 1:2414168/55‑1 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATatgaat > 1:2550597/1‑69 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATatgaat > 1:3242637/1‑69 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATatgaat > 1:358581/1‑69 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATatgaat > 1:423879/1‑69 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATatgaat > 1:2691077/1‑69 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATatgaat > 1:2579533/1‑69 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATatgaat > 1:1545829/1‑69 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATatgaat > 1:776286/1‑69 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATatgaat > 1:838735/1‑69 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATatgaat > 1:192348/1‑69 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATatgaat > 1:84618/1‑69 (MQ=255) acCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATatgaat > 1:1808354/1‑69 (MQ=255) tGCTTCCGACAACTCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:2101981/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:1076960/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:1152365/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:669667/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:780519/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:3397358/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:3394004/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:1326012/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:2639197/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:1835230/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:1873676/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:1966901/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:2084267/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:2112626/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:2179130/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:227299/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:2640403/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:2880922/69‑1 (MQ=255) tGCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:2918848/69‑1 (MQ=255) gCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:525616/68‑1 (MQ=255) gCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:673415/68‑1 (MQ=255) gCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:113035/68‑1 (MQ=255) gCTTCCGACAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCAGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:1041962/68‑1 (MQ=255) ccGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTa < 1:1422463/65‑1 (MQ=255) ccGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTa < 1:789798/65‑1 (MQ=255) ccGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCT‑CGCGTa < 1:3428690/64‑1 (MQ=255) cGAAAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTg < 1:718352/35‑1 (MQ=255) gACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCgt < 1:1320614/68‑1 (MQ=255) aCAACGCGACCGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGt < 1:647780/61‑1 (MQ=255) cgcgACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGc < 1:2951441/69‑1 (MQ=255) gcgACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGc < 1:2968402/68‑1 (MQ=255) | TCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGC > minE/90868‑90979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |