| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 1,347,872 | G→A | 32.7% | E455E (GAG→GAA) | yegH → | fused predicted membrane proteins |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 1,347,872 | 0 | G | A | 32.7% | 112.6 / 66.2 | 128 | E455E (GAG→GAA) | yegH | fused predicted membrane proteins |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/46); new base A (20/22); total (60/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
ATGATATTCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTGAATATCACACCATTGCCGGGCTG > minE/1347814‑1347938 | aTGATATTCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTTGAGGATCTGGTGc < 1:2752657/69‑1 (MQ=255)aTGATATTCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGc < 1:2721094/69‑1 (MQ=255)aTGATATTCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGc < 1:2017873/69‑1 (MQ=255)aTGATATTCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGc < 1:669016/69‑1 (MQ=255) tGATATTCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGc < 1:3301663/68‑1 (MQ=255) tGATATTCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGc < 1:535193/68‑1 (MQ=255) tGATATTCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGATGGAGGATCTGGTGc < 1:2786594/68‑1 (MQ=255) atTCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAata < 1:110924/68‑1 (MQ=255) atTCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAata < 1:2556778/68‑1 (MQ=255) atTCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAata < 1:1650647/68‑1 (MQ=255) atTCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAata < 1:2246766/68‑1 (MQ=255) atTCAGAAGAATGCGAACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAata < 1:1198696/68‑1 (MQ=255) ttCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGTTGCAATAtg > 1:2227213/1‑69 (MQ=255) ttCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAatat > 1:2257696/1‑68 (MQ=255) ttCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAata < 1:547930/67‑1 (MQ=255) ttCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAata < 1:2135841/67‑1 (MQ=255) ttCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATAtg > 1:904323/1‑69 (MQ=255) ttCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATAtg > 1:2503376/1‑69 (MQ=255) ttCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATAtg > 1:203583/1‑69 (MQ=255) ttCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATAtg > 1:2791878/1‑69 (MQ=255) ttCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATAtg > 1:2211264/1‑69 (MQ=255) ttCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATAtg > 1:590898/1‑69 (MQ=255) ttCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATAtg > 1:2673615/1‑69 (MQ=255) ttCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATAtg > 1:2669662/1‑69 (MQ=255) ttCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATAtg > 1:2636617/1‑69 (MQ=255) cAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATAtgtg > 1:3003243/1‑69 (MQ=255) cAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATAtgtg > 1:2660075/1‑69 (MQ=255) cAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATAtgtg > 1:846779/1‑69 (MQ=255) cAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATAtgtg > 1:1332545/1‑69 (MQ=255) cAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATAtgt > 1:1644523/1‑68 (MQ=255) tGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGtgccgctgcc > 1:448217/1‑69 (MQ=255) tGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGtgccgctgcc > 1:1722221/1‑69 (MQ=255) tCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGa > 1:1203761/1‑68 (MQ=255) tCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGa > 1:3153089/1‑68 (MQ=255) tCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGa > 1:2061112/1‑68 (MQ=255) tCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGa > 1:2415955/1‑68 (MQ=255) tCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGa > 1:2278908/1‑68 (MQ=255) ccTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGaaa < 1:1730987/69‑1 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGc < 1:1144113/39‑1 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGaaaaa < 1:1455698/68‑1 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATAtgtggc > 1:2109863/1‑47 (MQ=39) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:2594975/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:679796/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:716483/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:2896519/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:60129/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:2695628/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:50654/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:2781723/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:396362/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:1043969/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:1762872/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:2046220/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:2279956/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:2445664/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGtgcc > 1:18662/1‑49 (MQ=255) ggACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTCCAATATGtgcc > 1:751271/1‑49 (MQ=39) ggACGGCGAATGGTAATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGaaaaa < 1:891906/68‑1 (MQ=255) gACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGc < 1:640814/38‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGCTGAAAAACGTg < 1:3080474/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:3373457/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:3353772/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:41251/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:1321217/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:330269/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:191026/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:1977859/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:655291/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:2921806/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:2070848/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:2182038/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:109776/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:1017268/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:2664239/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:2485816/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:2586205/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGTTGCAATATGTGCCGTTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:1489253/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGTGCCGTTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:249566/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGTGCCGTTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:1137934/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGTGCCGTTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:1168592/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGTGCCGTTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:551066/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGTGCCGTTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:756095/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGTGCCGTTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:3430136/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGTGCCGTTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:2332885/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGTGCCGTTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:1876436/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGTGCCGTTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:3098738/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGTGCCGTTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:3094706/69‑1 (MQ=255) cGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGCAATATGTGCCGTTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:1927758/69‑1 (MQ=255) cGAATGGTCATATGCCGCTGGAAGATCTGGTGGAATATGTGCCGTTGCCGCTGGATGAAAAACGTg < 1:2271907/66‑1 (MQ=255) gTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTGAATATcac > 1:1167545/1‑68 (MQ=255) gTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTGAATATcac > 1:2858808/1‑68 (MQ=255) gTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTGAATATcac > 1:1126947/1‑68 (MQ=255) gTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTGAATATcac > 1:54746/1‑68 (MQ=255) gTCATATGACGCTGTAGTATCTGGTGCAATATGTGACGCTGCCGCTGTATGAAAAActtt < 1:1837686/60‑4 (MQ=255) atatGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATTTGccgctgccgctg < 1:3310400/44‑1 (MQ=255) atGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTGAATATcac > 1:2470191/1‑63 (MQ=255) tGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTGAATATCACACCAtt > 1:2682606/1‑68 (MQ=255) tGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTGAATATCACACCATTg > 1:2867316/1‑69 (MQ=255) tGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTGAATATCACACCATTg > 1:1305313/1‑69 (MQ=255) ggaTCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTGAATATCACACCATTGCCGGGCTg < 1:747422/67‑1 (MQ=255) | ATGATATTCAGAAGAATGCGGACGGTTCCTGGACGGCGAATGGTCATATGCCGCTGGAGGATCTGGTGCAATATGTGCCGCTGCCGCTGGATGAAAAACGTGAATATCACACCATTGCCGGGCTG > minE/1347814‑1347938 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |