| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 1,363,056 | G→C | 47.7% | T182T (ACG→ACC) | metG → | methionyl‑tRNA synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 1,363,056 | 0 | G | C | 47.7% | 5.8 / 107.2 | 88 | T182T (ACG→ACC) | metG | methionyl‑tRNA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/44); new base C (16/26); total (18/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.08e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.20e-01 | |||||||||||
CTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGTAATGCGTGATTCTGAACACTTCTTCTTTGATCTGCCCTCTTTCAGCGAAAT > minE/1362993‑1363112 | cTGCGGCGCGACCTACAGGCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:1239841/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGTTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:2105692/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:300636/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:1845061/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:1923409/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:2200670/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:2260426/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:2420250/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:1000471/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:2574603/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:2744965/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:2475219/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:3013620/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:3279622/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:3337403/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:365730/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:426631/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:477754/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:995402/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:1255912/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:1632170/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:1097194/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:1700008/69‑1 (MQ=255)cTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:1796054/69‑1 (MQ=255) tGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:1097352/68‑1 (MQ=255) cggcgCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:770810/66‑1 (MQ=255) ggcgCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt < 1:3380526/65‑1 (MQ=255) gcgACCTACATCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGTAATGCGt < 1:2595265/69‑1 (MQ=255) gcgACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGTAATGCGt < 1:2599212/69‑1 (MQ=255) gcgACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGTAATGCGt < 1:1917503/69‑1 (MQ=255) gcgACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGTAATGCGt < 1:2103363/69‑1 (MQ=255) gcgACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGTAATGCGt < 1:1423475/69‑1 (MQ=255) gcgACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGTAATGCGt < 1:2951292/69‑1 (MQ=255) gcgACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGTAATGCGt < 1:359786/69‑1 (MQ=255) cAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGt > 1:2081037/1‑54 (MQ=255) aacttaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGATTCTGAACActtcttct > 1:452043/1‑69 (MQ=255) aactgaTTGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGATTCTGAACActtcttct > 1:1381956/1‑69 (MQ=255) aactgaTCGGGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:2748140/54‑1 (MQ=255) aactgaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:1133250/54‑1 (MQ=255) aactgaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:2972525/54‑1 (MQ=255) aactgaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:1334228/54‑1 (MQ=255) aactgaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:3007219/54‑1 (MQ=255) aactgaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:1321128/54‑1 (MQ=255) aactgaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:3158675/54‑1 (MQ=255) aactgaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:3243471/54‑1 (MQ=255) aactgaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:1827512/54‑1 (MQ=255) aactgaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:425711/54‑1 (MQ=255) aactgaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:586328/54‑1 (MQ=255) aactgaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:783064/54‑1 (MQ=255) aactgaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:837966/54‑1 (MQ=255) aactgaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:923956/54‑1 (MQ=255) aactgaTCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGAtt < 1:1993186/54‑1 (MQ=255) 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1:445892/44‑1 (MQ=255) tCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGTAATGCGTGATTCTGAaca < 1:2395739/55‑1 (MQ=255) aGCCGAAATCGGTGGTTTCTTGTGCTACCCCGGTAATGCGTGATTCTGAACACTTCTTCTTTGATCTGc > 1:2431530/1‑69 (MQ=255) aGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGATTCTGAACACTTCTTCTTTGATCTGc > 1:3079380/1‑69 (MQ=255) aGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGATTCTGAACACTTCTTCTTTGATCTGc > 1:1556549/1‑69 (MQ=255) aGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGATTCTGAACACTTCTTCTTTGATCTGc > 1:617242/1‑69 (MQ=255) aGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGATTCTGAACACTTCTTCTTTGATCTGc > 1:1887362/1‑69 (MQ=255) aGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGATTCTGAACACTTCTTCTTTGATCTGc > 1:2872782/1‑69 (MQ=255) aGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGTGCTACCCCGGTAATGCGTGATTCTGAACACTTCTTCTTTGATCTGc > 1:1824474/1‑69 (MQ=255) gCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGTAATGCGTGATTCTGAACACTTCTTCTTTGATCTGc < 1:1565139/68‑1 (MQ=255) gtTTCTGGCGCTACGCCGGTAATGCGTGATTCTGAACACTTCTTCTTTGATCTGCCCTCTTTCAGCGaa < 1:1882608/69‑1 (MQ=255) ttCTGGCGCTACGCCGGTAATGCGTGATTCTGAACACTTCTTCTTTGATCTGCCCTCTTTCAGCGAAAt < 1:1069698/69‑1 (MQ=255) gcgcTACGCCGGTAATGCGTGATTCTGAACACTTCTTCTTTGATCTGCCCTCTTTCAGCGAAAt < 1:465746/64‑1 (MQ=255) | CTGCGGCGCGACCTACAGCCCGACTGAACTGATCGAGCCGAAATCGGTGGTTTCTGGCGCTACGCCGGTAATGCGTGATTCTGAACACTTCTTCTTTGATCTGCCCTCTTTCAGCGAAAT > minE/1362993‑1363112 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |