Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | minE | 1,611,483 | G→A | 47.3% | Y85Y (TAC→TAT) | eutB ← | ethanolamine ammonia‑lyase, large subunit, heavy chain |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | minE | 1,611,483 | 0 | G | A | 47.3% | 8.9 / 79.5 | 93 | Y85Y (TAC→TAT) | eutB | ethanolamine ammonia‑lyase, large subunit, heavy chain |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/16); new base A (16/28); total (49/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.66e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.26e-01 |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CCACGCTGGTTTCATCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTCATCTTCATAGGCAAT > minE/1611416‑1611545 | ccACGCTGGTTTCATCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTg < 1:1847624/68‑1 (MQ=255) ccACGCTGGTTTCATCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTg < 1:1755019/68‑1 (MQ=255) ccACGCTGGTTTCATCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTg < 1:2505592/68‑1 (MQ=255) ccACGCTGGTTTCATCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTg < 1:2407905/68‑1 (MQ=255) ccACGCTGGTTTCATCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTg < 1:3390996/68‑1 (MQ=255) ccACGCTGGTTTCATCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTg < 1:562776/68‑1 (MQ=255) ccACGCTGGTTTCATCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTg < 1:2074611/68‑1 (MQ=255) ttCATCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTg > 1:1562858/1‑58 (MQ=255) ttCATCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTg > 1:2591843/1‑58 (MQ=255) ttCATCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTg > 1:1951084/1‑58 (MQ=255) ttCATCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTg > 1:1285326/1‑58 (MQ=255) ttCATCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTg > 1:674211/1‑58 (MQ=255) ttCATCGCTCAGCACATACTCACGAAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTg > 1:170382/1‑58 (MQ=255) tCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGtt < 1:1472781/68‑1 (MQ=255) tCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGtt < 1:2861422/68‑1 (MQ=255) tCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGtt < 1:3423543/68‑1 (MQ=255) cTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGt > 1:2669403/1‑53 (MQ=255) cTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGa > 1:1516486/1‑67 (MQ=255) cTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGa > 1:2858829/1‑67 (MQ=255) tCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATc > 1:637778/1‑69 (MQ=255) tCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATc > 1:626305/1‑69 (MQ=255) tCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATc > 1:2856604/1‑69 (MQ=255) tCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATc > 1:792129/1‑69 (MQ=255) cAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGttt > 1:3367409/1‑44 (MQ=255) cAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGcc > 1:713560/1‑68 (MQ=255) cAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCcg > 1:1001210/1‑69 (MQ=255) cAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCcg > 1:1888368/1‑69 (MQ=255) cAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCcg > 1:3433322/1‑69 (MQ=255) cAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCcg > 1:1862650/1‑69 (MQ=255) cAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCcg > 1:2031906/1‑69 (MQ=255) cAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCcg > 1:2281395/1‑69 (MQ=255) tCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGt > 1:2073365/1‑68 (MQ=255) tCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGt > 1:2722794/1‑68 (MQ=255) tCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGt > 1:3009566/1‑68 (MQ=255) tCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGt > 1:165508/1‑68 (MQ=255) tCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGt > 1:3241459/1‑68 (MQ=255) tCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGt > 1:409482/1‑68 (MQ=255) tCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTc > 1:3164064/1‑69 (MQ=255) tCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTc > 1:1135682/1‑69 (MQ=255) tCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGCTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTc > 1:1442588/1‑69 (MQ=255) tCGCTGATGCTCCAGTATTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGt > 1:927425/1‑68 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTg > 1:625858/1‑55 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTg > 1:1425119/1‑55 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCa > 1:2428507/1‑69 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGTCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATAAGCCGCGTCa > 1:1877841/1‑69 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTg > 1:2047793/1‑55 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGt > 1:1803758/1‑67 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCa > 1:2021616/1‑69 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCa > 1:3120558/1‑69 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCa > 1:1324786/1‑69 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCa > 1:711088/1‑69 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCa > 1:1491843/1‑69 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCa > 1:1461228/1‑69 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCa > 1:1795550/1‑69 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCa > 1:461474/1‑69 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCa > 1:2299421/1‑69 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCa > 1:2369253/1‑69 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCa > 1:532370/1‑69 (MQ=255) cGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTAGTCCTGa > 1:7407/1‑56 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACg < 1:2705206/68‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACg < 1:2342528/68‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACg < 1:2624018/68‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACg < 1:1916946/68‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACg < 1:823746/68‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACg < 1:2287074/68‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACg < 1:3252365/68‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACg < 1:165254/68‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:1330568/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:381286/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:3430491/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:1302893/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:2073072/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:2406767/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:2902023/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:2900188/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:2896091/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:2889354/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:178549/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:895294/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:2714784/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:905863/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:2447060/69‑1 (MQ=255) tGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:2402589/69‑1 (MQ=255) gATGCACCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:1674573/68‑1 (MQ=255) aTGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTATAGGCCGTTTCGTTAACGTCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGc < 1:1502039/67‑1 (MQ=255) tGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGt > 1:3138853/1‑69 (MQ=255) tGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGt > 1:1965560/1‑69 (MQ=255) gCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTc < 1:511708/69‑1 (MQ=255) gCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTc < 1:1352252/69‑1 (MQ=255) gCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTc < 1:1455330/69‑1 (MQ=255) gCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTc < 1:1500511/69‑1 (MQ=255) gCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTc < 1:3122159/69‑1 (MQ=255) gCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTc < 1:1723146/69‑1 (MQ=255) gCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTc < 1:2725426/69‑1 (MQ=255) gCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTc < 1:908752/69‑1 (MQ=255) gCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTc < 1:948435/69‑1 (MQ=255) cTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTc < 1:3288447/68‑1 (MQ=255) cTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTCATCTTCATAGGCAAt < 1:774959/69‑1 (MQ=255) cTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTCATCTTCATAGGCAAt < 1:2907700/69‑1 (MQ=255) cTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTCATCTTCATAGGCAAt < 1:1905975/69‑1 (MQ=255) | CCACGCTGGTTTCATCGCTCAGCACATACTCACGCAGTTCGCTGATGCTCCAGTTTTTAATCTGGTTGTAGGCCGTTTCGTTAACATCGTCCTGAATCAGCCGCGTCACGCAGTCATCTTCATAGGCAAT > minE/1611416‑1611545 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |