| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 152,487 | G→A | 52.9% | H407H (CAC→CAT) | hemL ← | glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 152,487 | 0 | G | A | 52.9% | 4.0 / 76.3 | 87 | H407H (CAC→CAT) | hemL | glutamate‑1‑semialdehyde aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (26/15); new base A (16/30); total (42/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.01e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.35e-01 | |||||||||||
CACAACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGCAT > minE/152428‑152552 | cacaACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACg > 1:1093476/1‑69 (MQ=255) aaCTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGa < 1:1753221/68‑1 (MQ=255) ttCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATa < 1:3106048/69‑1 (MQ=255) ttCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATa < 1:2476897/69‑1 (MQ=255) cGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCa < 1:2130588/69‑1 (MQ=255) cGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCa < 1:2587960/69‑1 (MQ=255) cGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCa < 1:2667335/69‑1 (MQ=255) cGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCa < 1:1251454/69‑1 (MQ=255) cGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCa < 1:1142076/69‑1 (MQ=255) cGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGAACATAAAGCCCGCTTCaaa < 1:191410/68‑1 (MQ=255) cagcaTCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCt > 1:2995113/1‑68 (MQ=255) cagcaTCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCt > 1:1172069/1‑68 (MQ=255) cagcaTCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTg > 1:1227757/1‑69 (MQ=255) cagcaTCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTg > 1:1192505/1‑69 (MQ=255) cagcaTCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTg > 1:523503/1‑69 (MQ=255) gcaTCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGAc < 1:3431155/69‑1 (MQ=255) gcaTCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGAc < 1:1690819/69‑1 (MQ=255) gcaTCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTAAAACGCTGAc < 1:2567738/69‑1 (MQ=255) aTCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:871498/68‑1 (MQ=255) gATTGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCg > 1:1571068/1‑50 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCt > 1:2247520/1‑61 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCt > 1:1450389/1‑61 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCTCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:2217592/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:3385216/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:2568637/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:3279690/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:3237146/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:2549335/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:3084089/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:2759100/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:2918491/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:2887105/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:531264/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:691101/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:1030578/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:873318/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:1215640/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:86420/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:757507/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:1482436/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:752140/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:725572/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:2296763/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:1666724/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:605561/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:1744332/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:1965413/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:2022740/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:2061270/65‑1 (MQ=255) gATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:2068920/65‑1 (MQ=255) tGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGcc < 1:974529/68‑1 (MQ=255) tgtTATTGATATCATCCTTGCTGTGCGCCACGTACATa < 1:732719/38‑1 (MQ=25) gtTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTa < 1:362857/69‑1 (MQ=255) ttATTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACg < 1:3142381/58‑1 (MQ=255) aatGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:2681914/3‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:104763/1‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:851071/1‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:1412219/1‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:1504120/1‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:151586/1‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:1649469/1‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:1235235/1‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:2327237/1‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:380702/1‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:1188129/1‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:907920/1‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:2672094/1‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:3145887/1‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:94807/1‑63 (MQ=255) aTTGATATCTTCCATGCTATGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAg > 1:3071362/1‑63 (MQ=255) ccATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCa > 1:2599906/1‑35 (MQ=255) gCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTaaa > 1:2709888/1‑53 (MQ=255) gCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:2390067/1‑69 (MQ=255) gCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:3381199/1‑69 (MQ=255) gCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:374415/1‑69 (MQ=255) gCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:3308876/1‑69 (MQ=255) gCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:2869129/1‑69 (MQ=255) gCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:1302646/1‑69 (MQ=255) gCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:703016/1‑69 (MQ=255) cTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:381353/1‑68 (MQ=255) cTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:828766/1‑68 (MQ=255) cTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:1741166/1‑68 (MQ=255) cTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:1917678/1‑68 (MQ=255) cTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:2585512/1‑68 (MQ=255) cTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:330597/1‑68 (MQ=255) cTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:3073681/1‑68 (MQ=255) cTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGcat > 1:2821301/1‑68 (MQ=255) | CACAACTTCGCAAACACCCGACGTGCAGCATCGATGGTGTTATTGATATCTTCCATGCTGTGCGCCACGGACATAAAGCCCGCTTCAAACGCTGACGGTGCCAGGTAAACACCTTCGTCCAGCAT > minE/152428‑152552 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |