| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 1,987,051 | T→C | 30.9% | P224P (CCA→CCG) | ansB ← | periplasmic L‑asparaginase II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 1,987,051 | 0 | T | C | 30.9% | 73.1 / 40.7 | 84 | P224P (CCA→CCG) | ansB | periplasmic L‑asparaginase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/27); new base C (11/15); total (42/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
TAGTTATAAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGTAACC > minE/1986998‑1987119 | tAGTTATAAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGt > 1:1530912/1‑68 (MQ=255)tAGTTATAAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTa > 1:1006591/1‑69 (MQ=255) tataAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCt < 1:2839745/69‑1 (MQ=255) ataAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:1879865/62‑1 (MQ=255) ataAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:2096322/62‑1 (MQ=255) ataAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:2142474/62‑1 (MQ=255) ataAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:1744491/62‑1 (MQ=255) ataAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:3180790/62‑1 (MQ=255) ataAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:362454/62‑1 (MQ=255) ataAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:1407043/62‑1 (MQ=255) ataAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:1183329/62‑1 (MQ=255) ataAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:2581750/62‑1 (MQ=255) ataAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:969495/62‑1 (MQ=255) cAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTg > 1:2488577/1‑69 (MQ=255) cAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTg > 1:276603/1‑69 (MQ=255) cAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTg > 1:742070/1‑69 (MQ=255) cAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTg > 1:3325630/1‑69 (MQ=255) cAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTg > 1:692814/1‑69 (MQ=255) cAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTg > 1:1672317/1‑69 (MQ=255) cAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTg > 1:3377579/1‑69 (MQ=255) cAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTg > 1:1694766/1‑69 (MQ=255) aaTGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGc < 1:3052328/69‑1 (MQ=255) gCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCgg > 1:735802/1‑69 (MQ=255) ccGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCTCTgg < 1:1645576/52‑1 (MQ=255) ccGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:2874759/52‑1 (MQ=255) ccGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:2185392/52‑1 (MQ=255) ccGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:2123450/52‑1 (MQ=255) ccGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:2432778/52‑1 (MQ=255) ccGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg > 1:2727391/1‑52 (MQ=255) ccGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg > 1:1112687/1‑52 (MQ=255) ccGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTgg < 1:1611767/52‑1 (MQ=255) tCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCggg > 1:1828350/1‑62 (MQ=255) tCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCggg > 1:3182031/1‑62 (MQ=255) tCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCggg > 1:2660590/1‑62 (MQ=255) tCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCggg > 1:230536/1‑62 (MQ=255) tCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCgg > 1:2146014/1‑61 (MQ=255) aGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTa > 1:1567993/1‑68 (MQ=255) aGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTa > 1:2585911/1‑68 (MQ=255) aGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTa > 1:1255278/1‑68 (MQ=255) aGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTa > 1:105158/1‑68 (MQ=255) aGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTa > 1:2030374/1‑68 (MQ=255) aGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTa > 1:387053/1‑68 (MQ=255) aGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTa > 1:2692422/1‑68 (MQ=255) aGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTa > 1:1769901/1‑68 (MQ=255) aGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTa > 1:3321722/1‑68 (MQ=255) aGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTa > 1:3186810/1‑68 (MQ=255) aGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCC‑GGGTACGTTGGTAg > 1:2073426/1‑68 (MQ=255) caGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCtt > 1:509154/1‑69 (MQ=255) caGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCtt > 1:2894493/1‑69 (MQ=255) caGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCtt > 1:2301292/1‑69 (MQ=255) cATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGaa > 1:926271/1‑69 (MQ=255) cATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGaa > 1:2570172/1‑69 (MQ=255) cATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGaa > 1:999020/1‑69 (MQ=255) cATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGaa > 1:2675514/1‑69 (MQ=255) cATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGaa > 1:2172885/1‑69 (MQ=255) cGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt > 1:640065/1‑69 (MQ=255) cGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt > 1:2329585/1‑69 (MQ=255) cGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt > 1:2615751/1‑69 (MQ=255) cGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt > 1:257021/1‑69 (MQ=255) cGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt > 1:1313076/1‑69 (MQ=255) cGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:1685137/69‑1 (MQ=255) cGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:1043050/69‑1 (MQ=255) cGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:114768/69‑1 (MQ=255) cGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:868286/69‑1 (MQ=255) cGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:1191071/69‑1 (MQ=255) cGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:1425128/69‑1 (MQ=255) cGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:1446185/69‑1 (MQ=255) cGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:150972/69‑1 (MQ=255) cGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:2652967/69‑1 (MQ=255) cGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:208358/69‑1 (MQ=255) cGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:2171164/69‑1 (MQ=255) cGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:2235658/69‑1 (MQ=255) cGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:2595921/69‑1 (MQ=255) cGAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACCTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:1043819/69‑1 (MQ=255) gAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGTa < 1:1780537/69‑1 (MQ=255) gAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGTa < 1:3292428/69‑1 (MQ=255) gAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGTa < 1:1455442/69‑1 (MQ=255) gAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGTa < 1:724096/69‑1 (MQ=255) gAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGTa < 1:1296992/69‑1 (MQ=255) gAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGTa < 1:3101124/69‑1 (MQ=255) gAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGTa < 1:809599/69‑1 (MQ=255) gAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGTa < 1:2927329/69‑1 (MQ=255) gAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGTa < 1:2637750/69‑1 (MQ=255) gAACGGCGTGTCGCTGGTGTGCTTACGTGCCGGGGTACGTTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGt < 1:317566/68‑1 (MQ=255) tGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGTAAcc < 1:1877028/69‑1 (MQ=255) | TAGTTATAAACAATGCCGACTTTCGGCAGTTCATTCAGCTTAGAGACATCGAATGGCGTGTCGCTGGTATGCTTACGTGCCGGGGTACGCTGGTAGTCAATCTTACCGTTGTGAATGTAACC > minE/1986998‑1987119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |