| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 1,987,156 | G→A | 30.8% | D189D (GAC→GAT) | ansB ← | periplasmic L‑asparaginase II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 1,987,156 | 0 | G | A | 30.8% | 92.1 / 45.4 | 97 | D189D (GAC→GAT) | ansB | periplasmic L‑asparaginase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (24/43); new base A (9/21); total (33/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.77e-01 | |||||||||||
CAATCTTACCGTTGTGAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCAT > minE/1987095‑1987209 | cAATCTTACCGTTGTGAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCggtgg > 1:2916988/1‑69 (MQ=255)cAATCTTACCGTTGTGAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCggtgg > 1:1027066/1‑69 (MQ=255)cAATCTTACCGTTGTGAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCggtgg > 1:2475283/1‑69 (MQ=255) cGTTGTGAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTg < 1:2287345/65‑1 (MQ=255) cGTTGTGAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTg < 1:2660165/65‑1 (MQ=255) cGTTGTGAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTg < 1:1979997/65‑1 (MQ=255) cGTTGTGAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTg < 1:3342464/65‑1 (MQ=255) cGTTGTGAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGt < 1:3286982/67‑1 (MQ=255) cGTTGTGAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGt < 1:139121/67‑1 (MQ=255) cGTTGTGAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGt < 1:1368654/67‑1 (MQ=255) cGTTGTGAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGt < 1:3251615/67‑1 (MQ=255) gTTGTGAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGt < 1:2834644/66‑1 (MQ=255) gtgAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGt < 1:3372095/69‑1 (MQ=255) gAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTg < 1:2408705/68‑1 (MQ=255) gAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTg < 1:676297/68‑1 (MQ=255) gAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTg < 1:2076788/68‑1 (MQ=255) gAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTg < 1:1430787/68‑1 (MQ=255) gAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTg < 1:2584354/68‑1 (MQ=255) gAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCACTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTg < 1:290493/68‑1 (MQ=255) aaTGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGa > 1:309889/1‑68 (MQ=255) aaTGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGAc > 1:26780/1‑69 (MQ=255) aaTGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGAc > 1:1174556/1‑69 (MQ=255) aaTGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGAc > 1:1489688/1‑69 (MQ=255) aaTGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGAc > 1:529957/1‑69 (MQ=255) tGTAACCCAGAGGGCCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGt > 1:2009044/1‑69 (MQ=255) tGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACg > 1:405872/1‑68 (MQ=255) tGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGt > 1:2616249/1‑69 (MQ=255) tGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGt > 1:229769/1‑69 (MQ=255) tGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGt > 1:2251941/1‑69 (MQ=255) tGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGt > 1:1581681/1‑69 (MQ=255) tGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGt > 1:2950675/1‑69 (MQ=255) tGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGt > 1:1465702/1‑69 (MQ=255) tGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGt > 1:3033549/1‑69 (MQ=255) tGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGt > 1:3337232/1‑69 (MQ=255) tGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGt > 1:3427743/1‑69 (MQ=255) tGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGt > 1:766089/1‑69 (MQ=255) tGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGt > 1:1034403/1‑69 (MQ=255) ccAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACgg < 1:639423/68‑1 (MQ=255) cAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACgg < 1:335946/67‑1 (MQ=255) cAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGcc > 1:803700/1‑69 (MQ=255) cAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGcc > 1:2395794/1‑69 (MQ=255) ggACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCa > 1:2502326/1‑69 (MQ=255) gTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGgt < 1:2252404/69‑1 (MQ=255) gTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGgt < 1:1356038/69‑1 (MQ=255) gTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGgt < 1:1262024/69‑1 (MQ=255) gTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGgt < 1:1153027/69‑1 (MQ=255) gTTAACAGACTTGAAGGGCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGgt < 1:2218233/69‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:1059138/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:730060/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:478128/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:1143405/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:105095/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:835019/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:1260244/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:3295647/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:3136646/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:966675/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:3095842/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:3023779/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:1669795/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:2206986/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:2202131/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:273662/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:1827249/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:1898421/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:2367721/68‑1 (MQ=255) tAACAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:2598598/68‑1 (MQ=255) aaCAGACTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGgtg < 1:1903173/67‑1 (MQ=255) aGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTTGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcatt < 1:796092/69‑1 (MQ=255) aGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcatt < 1:1164135/69‑1 (MQ=255) aGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcatt < 1:94880/69‑1 (MQ=255) aGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcatt < 1:884408/69‑1 (MQ=255) aGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcatt < 1:2336650/69‑1 (MQ=255) aGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcatt < 1:533661/69‑1 (MQ=255) aGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcatt < 1:1099761/69‑1 (MQ=255) aGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcatt < 1:1139193/69‑1 (MQ=255) aGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcatt < 1:283144/69‑1 (MQ=255) aGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcatt < 1:2974707/69‑1 (MQ=255) aGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcatt < 1:1398320/69‑1 (MQ=255) aGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcatt < 1:1959533/69‑1 (MQ=255) cTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcattcat < 1:328050/69‑1 (MQ=255) cTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGGTGtcgttcat > 1:1072392/1‑69 (MQ=255) cTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGGTGtcgttcat > 1:2723768/1‑69 (MQ=255) cTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGGTGtcgttcat > 1:1061751/1‑69 (MQ=255) cTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGGTGtcgttcat > 1:673904/1‑69 (MQ=255) cTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGGTGtcgttcat > 1:550608/1‑69 (MQ=255) cTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGGTGtcgttcat > 1:320443/1‑69 (MQ=255) cTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGGTGtcgttcat > 1:1708949/1‑69 (MQ=255) cTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGGTGtcgttcat > 1:1188041/1‑69 (MQ=255) cTTGAAGGTCGCTACATCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACATCACGGCCATCAAGCACGGTGtcgttca > 1:2032486/1‑68 (MQ=255) cGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcattcat < 1:1271925/60‑1 (MQ=255) cGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcattcat < 1:2111446/60‑1 (MQ=255) cGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcattcat < 1:3174165/60‑1 (MQ=255) cGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcattcat < 1:2352474/60‑1 (MQ=255) cGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcattcat < 1:1963894/60‑1 (MQ=255) cGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcattcat < 1:1544812/60‑1 (MQ=255) cGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGtcattcat < 1:1625732/60‑1 (MQ=255) | CAATCTTACCGTTGTGAATGTAACCCAGAGGACCGTAGTTAACAGACTTGAAGGTCGCTACGTCGGTGGTGTTGGTTTTGGTGACGTCACGGCCATCAAGCACGGTGTCATTCAT > minE/1987095‑1987209 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |