| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 2,048,438 | C→T | 45.6% | V639V (GTG→GTA) | glnE ← | fused deadenylyltransferase and adenylyltransferase for glutamine synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 2,048,438 | 0 | C | T | 45.6% | 15.7 / 76.7 | 92 | V639V (GTG→GTA) | glnE | fused deadenylyltransferase and adenylyltransferase for glutamine synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/20); new base T (20/22); total (50/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CACGCCTGCTGAACGACGGCATCTATCATGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCTGCGGCGATGCGTAACAGCTGCGCCTGTTTGAACTG > minE/2048370‑2048500 | cACGCCTGCTGAACGACGGCATCTATCATGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTtcatc < 1:1211350/69‑1 (MQ=255)cACGCCTGCTGAACGACGGCATCTATCATGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTtcatc < 1:2677948/69‑1 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCCGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:1035152/1‑69 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGt > 1:557717/1‑68 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGt > 1:2763407/1‑68 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:3362151/1‑69 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:161020/1‑69 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:1795185/1‑69 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:1972423/1‑69 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:2142928/1‑69 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:2667972/1‑69 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:3051575/1‑69 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:3053368/1‑69 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:1017763/1‑69 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:375993/1‑69 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:54384/1‑69 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:707662/1‑69 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:774058/1‑69 (MQ=255) gctgAACGACGGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTa > 1:79342/1‑69 (MQ=255) 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cgacgGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTAGCGt < 1:1096839/67‑1 (MQ=255) cgacgGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTAGCGt < 1:2564342/67‑1 (MQ=255) cgacgGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTAGCGt < 1:1408550/67‑1 (MQ=255) cgacgGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTAGCGt < 1:2856938/67‑1 (MQ=255) cgacgGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTAGCGt < 1:3312304/67‑1 (MQ=255) cgacgGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTAGCGt < 1:1274165/67‑1 (MQ=255) cgacgGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTAGCGt < 1:3115017/67‑1 (MQ=255) cgacgGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTAGCGt < 1:1492154/67‑1 (MQ=255) cgacgGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTAGCGt < 1:1674021/67‑1 (MQ=255) cgacgGCATCAATCATGGCTTCTGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATTACCGGTAGCGt < 1:1999568/67‑1 (MQ=255) 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tATCATGGCTTCCGCCAGCCATGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGatat > 1:1645787/1‑68 (MQ=255) tATCATGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATc > 1:1365893/1‑69 (MQ=255) tATCATGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATc > 1:2826521/1‑69 (MQ=255) tATCATGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATc > 1:2830049/1‑69 (MQ=255) tATCATGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATc > 1:2744846/1‑69 (MQ=255) tATCATGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATc > 1:1994869/1‑69 (MQ=255) tATCATGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATc > 1:2885224/1‑69 (MQ=255) tATCATGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATc > 1:1729657/1‑69 (MQ=255) tATCATGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATc > 1:1049681/1‑69 (MQ=255) tATCATGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATc > 1:2034765/1‑69 (MQ=255) aTGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATGGCTCACTATCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCt > 1:1252922/1‑69 (MQ=255) aTGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCgg > 1:434717/1‑47 (MQ=255) aTGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCgg > 1:384548/1‑47 (MQ=255) aTGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCgg > 1:354815/1‑47 (MQ=255) aTGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCgg > 1:2866634/1‑47 (MQ=255) aTGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCgg > 1:3064092/1‑47 (MQ=255) aTGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCgg > 1:2643899/1‑47 (MQ=255) aTGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCt > 1:2176015/1‑69 (MQ=255) aTGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCt > 1:2257296/1‑69 (MQ=255) aTGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCt > 1:1947898/1‑69 (MQ=255) aTGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCt > 1:678449/1‑69 (MQ=255) aTGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCt > 1:2662691/1‑69 (MQ=255) aTGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCt > 1:869957/1‑69 (MQ=255) aTGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCt > 1:2974410/1‑69 (MQ=255) ttCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCTgcggc < 1:2757371/69‑1 (MQ=255) gccagGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCTGCGGCGATGCGTa < 1:580190/69‑1 (MQ=255) gccagGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCTGCGGCGATGCGTa < 1:1219251/69‑1 (MQ=255) gccagGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCTGCGGCGATGCGTa < 1:1875750/69‑1 (MQ=255) tAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCTGCGGCGATGCGTAACAGCTg > 1:491751/1‑69 (MQ=255) tAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCTGCGGCGATGCGTAACAGCTg > 1:173804/1‑69 (MQ=255) tAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCTGCGGCGATGCGTAACAGCTg > 1:318627/1‑69 (MQ=255) aTCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCTGCGGCGATGCGTAACAGCTGCGCCTg < 1:1832603/69‑1 (MQ=255) 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tttCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCTGCGGCGATGCGTAACAGCTGCGCCTGTTTGAACt < 1:1157333/68‑1 (MQ=255) tttCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCTGCGGCGATGCGTAACAGCTGCGCCTGTTTGAACTg > 1:2186882/1‑69 (MQ=255) tttCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCTGCGGCGATGCGTAACAGCTGCGCCTGTTTGAACTg > 1:400660/1‑69 (MQ=255) | CACGCCTGCTGAACGACGGCATCTATCATGGCTTCCGCCAGCCAGGTTAAGTGATCGCTCACTTTCATCACCGGTAGCGTACCGGCGATATCCGCTGCGGCGATGCGTAACAGCTGCGCCTGTTTGAACTG > minE/2048370‑2048500 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |