| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 2,087,781 | T→C | 33.9% | F92F (TTT→TTC) | yhaH → | predicted inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 2,087,781 | 0 | T | C | 33.9% | 78.5 / 59.3 | 106 | F92F (TTT→TTC) | yhaH | predicted inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/35); new base C (21/15); total (56/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
TCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGAAAACCGCTTTGG > minE/2087715‑2087846 | tCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTAt > 1:2485642/1‑69 (MQ=255)tCAGTTCCGCCGCCTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTAt > 1:2043363/1‑69 (MQ=255) ccTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCttat < 1:821330/69‑1 (MQ=255) ccTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCttat < 1:1038658/69‑1 (MQ=255) ccTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCttat < 1:2133706/69‑1 (MQ=255) ccTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCttat < 1:2768536/69‑1 (MQ=255) ccTGCACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCttat < 1:58846/69‑1 (MQ=255) cACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTtattat > 1:519002/1‑68 (MQ=255) cACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc > 1:942209/1‑69 (MQ=255) cACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc > 1:2422998/1‑69 (MQ=255) cACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc > 1:2139020/1‑69 (MQ=255) cACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc > 1:1937378/1‑69 (MQ=255) cACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc > 1:1910910/1‑69 (MQ=255) cACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc > 1:3173103/1‑69 (MQ=255) cACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc > 1:1386915/1‑69 (MQ=255) cACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc > 1:1362899/1‑69 (MQ=255) cACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc > 1:381776/1‑69 (MQ=255) cACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc > 1:1092242/1‑69 (MQ=255) cACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc > 1:119732/1‑69 (MQ=255) cACGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTAGTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc > 1:3113542/1‑69 (MQ=255) cGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc < 1:3143134/67‑1 (MQ=255) cGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc < 1:2331344/67‑1 (MQ=255) cGACACCGACCGCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTatc < 1:1427242/67‑1 (MQ=255) cgaccgCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGttt > 1:325016/1‑43 (MQ=255) cgaccgCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGttt > 1:3136549/1‑43 (MQ=255) cgaccgCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGttt > 1:328104/1‑43 (MQ=255) cgaccgCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGttt > 1:717652/1‑43 (MQ=255) cgaccgCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGttt > 1:2897909/1‑43 (MQ=255) cgaccgCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGttt > 1:1945947/1‑43 (MQ=255) cgaccgCT‑GGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGttt > 1:1852419/1‑42 (MQ=255) gaccgCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCttt < 1:2145243/69‑1 (MQ=255) gaccgCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCttt < 1:730063/69‑1 (MQ=255) gaccgCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCttt < 1:1079557/69‑1 (MQ=255) gaccgCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCttt < 1:921433/69‑1 (MQ=255) gaccgCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCttt < 1:3308663/69‑1 (MQ=255) gaccgCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCttt < 1:3366724/69‑1 (MQ=255) gCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACt < 1:2259675/69‑1 (MQ=255) gCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACt < 1:683922/69‑1 (MQ=255) gCTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACt < 1:1985591/69‑1 (MQ=255) cTCGGCGTGGTGGGCACTGCTATTCTTAATCCAGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACt > 1:375129/1‑68 (MQ=255) gtggGCACTGCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCggg < 1:2334737/69‑1 (MQ=255) gCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAg > 1:354734/1‑68 (MQ=255) gCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAg > 1:24911/1‑68 (MQ=255) gCTATTCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAg > 1:3010450/1‑68 (MQ=255) tCTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACt < 1:3203302/45‑1 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTc < 1:3395605/37‑1 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTc < 1:2250500/37‑1 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTc < 1:2332542/37‑1 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTc < 1:1055018/37‑1 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTc < 1:1626074/37‑1 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTc < 1:1649350/37‑1 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTc < 1:2116483/37‑1 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTc < 1:2805345/37‑1 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTc < 1:730013/37‑1 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTc < 1:780595/37‑1 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTc < 1:193926/37‑1 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCTaaa > 1:1741337/1‑68 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGaaaa > 1:1049038/1‑69 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGaaaa > 1:554284/1‑69 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGaaaa > 1:1102659/1‑69 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGaaaa > 1:2877586/1‑69 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGaaaa > 1:2446885/1‑69 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGaaaa > 1:2152622/1‑69 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGaaaa > 1:838367/1‑69 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGaaaa > 1:833319/1‑69 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGaaaa > 1:783837/1‑69 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGaaaa > 1:768739/1‑69 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGaaa > 1:2592808/1‑68 (MQ=255) cTTAATCCCGTTTATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGCGaaa > 1:3429132/1‑68 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCa > 1:2200755/1‑48 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:1207164/1‑51 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:641664/1‑51 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:1235230/1‑51 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:583088/1‑51 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:1237100/1‑51 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:1500541/1‑51 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:507719/1‑51 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:483725/1‑51 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:1312122/1‑51 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:1373613/1‑51 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:1625055/1‑51 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:2620889/1‑51 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:3193553/1‑51 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:1271379/1‑51 (MQ=255) cTTAATCCCGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGc > 1:2839651/1‑51 (MQ=255) tgTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGc < 1:814065/55‑1 (MQ=255) cGTTCATCGTCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGc < 1:246033/56‑1 (MQ=39) cGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGc < 1:3060077/56‑1 (MQ=255) cGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGc < 1:2400039/56‑1 (MQ=255) cGTTCATCGGCTGGCTTATTATCATCGTCTTTAACTGCCAGGCGGGTACGCCAGGc < 1:2669556/56‑1 (MQ=255) 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minE/2087715‑2087846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |