| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 2,220,128 | A→T | 44.5% | intergenic (+388/‑590) | yhdH → / → accB | predicted oxidoreductase, Zn‑dependent and NAD(P)‑binding/acetyl CoA carboxylase, BCCP subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 2,220,128 | 0 | A | T | 44.5% | 29.6 / 98.4 | 92 | intergenic (+388/‑590) | yhdH/accB | predicted oxidoreductase, Zn‑dependent and NAD(P)‑binding/acetyl CoA carboxylase, BCCP subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/23); new base T (21/20); total (49/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.34e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACTCGAACCTATTTAATGCTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCT > minE/2220062‑2220189 | aCTCGAACCTATTTAATGCTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTa > 1:1116774/1‑67 (MQ=255) aTTTAATGCTGAGGATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGc < 1:641966/69‑1 (MQ=255) aTTTAATGCTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGc < 1:2660938/69‑1 (MQ=255) aTTTAATGCTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGc < 1:224186/69‑1 (MQ=255) aTTTAATGCTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGc < 1:1563751/69‑1 (MQ=255) tAATGCTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAg > 1:994167/1‑68 (MQ=255) tAATGCTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAg > 1:686730/1‑68 (MQ=255) tAATGCTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAg > 1:3190922/1‑68 (MQ=255) tAATGCTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAg > 1:1250360/1‑68 (MQ=255) tAATGCTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAg > 1:3008854/1‑68 (MQ=255) tAATGCTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAg > 1:107086/1‑68 (MQ=255) tAATGCTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAg > 1:1379174/1‑68 (MQ=255) cTGAGCATTGTCAATCTGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGaa < 1:2453476/67‑1 (MQ=255) cTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGaaaa > 1:2659609/1‑69 (MQ=255) cTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGaaaa > 1:2311658/1‑69 (MQ=255) cTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATCCAGTGaa < 1:2798390/67‑1 (MQ=255) cATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTgg > 1:1949025/1‑68 (MQ=255) gTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAAt > 1:480035/1‑69 (MQ=255) gTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAAt > 1:1257900/1‑69 (MQ=255) 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aaTCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCATACGATGCAGTGaa < 1:2802793/55‑1 (MQ=255) aaTCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGaa < 1:966477/55‑1 (MQ=255) aaTCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGaa < 1:1118771/55‑1 (MQ=255) ggTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGc > 1:1382272/1‑69 (MQ=255) ggTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGc > 1:1823458/1‑69 (MQ=255) ggTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGc > 1:1792074/1‑69 (MQ=255) cGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGaa < 1:2075797/40‑1 (MQ=255) gTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:3133097/68‑1 (MQ=255) gTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:810475/68‑1 (MQ=255) gTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:125766/68‑1 (MQ=255) gTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:3093408/68‑1 (MQ=255) gTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:672857/68‑1 (MQ=255) gTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:1178928/68‑1 (MQ=255) gTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:1083100/68‑1 (MQ=255) gTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:634487/68‑1 (MQ=255) gTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:1385690/68‑1 (MQ=255) gTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:2075920/68‑1 (MQ=255) gTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:2323723/68‑1 (MQ=255) gTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGt < 1:1696831/68‑1 (MQ=255) ttAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtc < 1:1494461/69‑1 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:2450982/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:338343/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:2166093/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:3087296/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:3044518/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:1978208/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:524976/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:567025/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:1736179/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:673946/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:1666972/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:1546423/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:2713224/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:2670217/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgtc > 1:87845/1‑68 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgt > 1:2262544/1‑67 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgt > 1:2801618/1‑67 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATgtcgt > 1:2192144/1‑67 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCt > 1:3403391/1‑69 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCt > 1:3228466/1‑69 (MQ=255) cATTCACATCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCt > 1:2434730/1‑69 (MQ=255) cacaTCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt > 1:24390/1‑69 (MQ=255) cacaTCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt > 1:2006799/1‑69 (MQ=255) cacaTCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt > 1:1319983/1‑69 (MQ=255) caTCTTTCCGTACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:2814259/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:628599/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:1367205/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:1306017/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:2491338/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:2725639/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:2749602/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:2766524/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:2290816/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:1865242/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:194611/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:2151090/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:5957/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:286960/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:219241/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:199820/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:3166103/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:2037020/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:1243142/67‑1 (MQ=255) caTCTTTCCGGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCt < 1:3344092/67‑1 (MQ=255) | ACTCGAACCTATTTAATGCTGAGCATTGTCAATCGGTTAATTTTGCGTGCTTTAGCATTCACATCTATCCAGACGATGCAGTGAAAATTGGGTAATCCCCAGCAACCGCTGCGTAATGTCGTCTATCT > minE/2220062‑2220189 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |