| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 2,413,415 | T→C | 30.7% | D270D (GAT→GAC) | aslA → | acrylsulfatase‑like enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 2,413,415 | 0 | T | C | 30.7% | 93.7 / 50.5 | 104 | D270D (GAT→GAC) | aslA | acrylsulfatase‑like enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/46); new base C (13/19); total (39/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CATGCGGTGCGCGGCGGCGAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCA > minE/2413353‑2413481 | cATGCGGTGCGCGGCGGCGAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGa > 1:1085322/1‑68 (MQ=255)cATGCGGTGCGCGGCGGCGAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGa > 1:2853497/1‑68 (MQ=255)cATGCGGTGCGCGGCGGCGAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGa > 1:2472065/1‑68 (MQ=255) gcgcGGCGGCGAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCtg < 1:1258093/69‑1 (MQ=255) gcgcGGCGGCGAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCtg < 1:2206433/69‑1 (MQ=255) gcgcGGCGGCGAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCtg < 1:3086427/69‑1 (MQ=255) gcgcGGCGGCGAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCtg < 1:3236561/69‑1 (MQ=255) gcgcGGCGGCGAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCtg < 1:2416293/69‑1 (MQ=255) gcgcGGCGGCGAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCtg < 1:3152097/69‑1 (MQ=255) cgAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTa < 1:376870/69‑1 (MQ=255) gAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTa < 1:989890/68‑1 (MQ=255) gAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTa < 1:1449873/68‑1 (MQ=255) gAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTa < 1:2481312/68‑1 (MQ=255) gAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTa < 1:3134112/68‑1 (MQ=255) gCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCt > 1:1203967/1‑68 (MQ=255) aCGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGAt > 1:2587003/1‑68 (MQ=255) aCGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATg > 1:1672406/1‑69 (MQ=255) aCGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATg > 1:2149187/1‑69 (MQ=255) ccGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATgg > 1:2703225/1‑67 (MQ=255) ccGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATgg > 1:2176046/1‑67 (MQ=255) gAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGaa < 1:751269/69‑1 (MQ=255) gAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGaa < 1:1529766/69‑1 (MQ=255) gAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGaa < 1:1430434/69‑1 (MQ=255) gAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGaa < 1:3396592/69‑1 (MQ=255) gAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGaa < 1:1887882/69‑1 (MQ=255) gAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGaa < 1:373373/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCTTCGACAAGATGGCGAagag < 1:1211681/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:419357/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:2971978/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:3007053/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:901376/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:3044467/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:3091368/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:1657946/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:1682876/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:329614/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:456472/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:483202/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:219580/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:3396530/69‑1 (MQ=255) tatatGTAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:830148/68‑1 (MQ=255) tatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:678591/68‑1 (MQ=255) tatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:2578360/68‑1 (MQ=255) tatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:846844/68‑1 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCATCGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:3089889/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGtt > 1:652804/1‑43 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:3411628/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:2868422/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:849273/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:310642/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:577184/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:3156021/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:3184975/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:1359169/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:2061287/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:2318459/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:2378867/1‑69 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATaa > 1:99729/1‑68 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATaa > 1:571640/1‑68 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATaa > 1:1839037/1‑68 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATaa > 1:1647589/1‑68 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATaa > 1:773225/1‑68 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATaa > 1:3046736/1‑68 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATaa > 1:1419916/1‑68 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATaa > 1:2618923/1‑68 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATa > 1:78036/1‑67 (MQ=255) aGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGaaa > 1:2417583/1‑57 (MQ=255) aGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAag > 1:2454463/1‑58 (MQ=255) aGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAag > 1:2300705/1‑58 (MQ=255) aGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAag > 1:750623/1‑58 (MQ=255) aGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAag > 1:699833/1‑58 (MQ=255) aGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAag > 1:2176610/1‑58 (MQ=255) aGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAag > 1:592881/1‑58 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1638802/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:2059199/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:57320/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1743325/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:622972/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1630644/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1440745/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1589381/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1888868/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:2634461/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:2508495/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1123932/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:2436110/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:3206324/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:3270370/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:3319531/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:3361253/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:3368072/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:2177389/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:2146955/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1064973/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1894818/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:55390/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCGCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:698390/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGGTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:2333658/69‑1 (MQ=255) aTCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1386555/68‑1 (MQ=255) aTCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:3042014/68‑1 (MQ=255) | CATGCGGTGCGCGGCGGCGAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCA > minE/2413353‑2413481 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |