| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 2,413,436 | C→A | 23.2% | D277E (GAC→GAA) | aslA → | acrylsulfatase‑like enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 2,413,436 | 0 | C | A | 23.2% | 272.3 / 62.1 | 150 | D277E (GAC→GAA) | aslA | acrylsulfatase‑like enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/78); new base A (16/19); total (53/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
CGAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCATTCTTCCTC > minE/2413370‑2413490 | gAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTa < 1:989890/68‑1 (MQ=255) gAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTa < 1:1449873/68‑1 (MQ=255) aCGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGAt > 1:2587003/1‑68 (MQ=255) aCGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATg > 1:2149187/1‑69 (MQ=255) aCGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATg > 1:1672406/1‑69 (MQ=255) ccGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATgg > 1:2176046/1‑67 (MQ=255) gAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGaa < 1:373373/69‑1 (MQ=255) gAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGaa < 1:3396592/69‑1 (MQ=255) gAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGaa < 1:1529766/69‑1 (MQ=255) gAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGaa < 1:751269/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCTTCGACAAGATGGCGAagag < 1:1211681/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:3091368/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:2971978/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:3431996/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:419357/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:483202/69‑1 (MQ=255) atatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:219580/69‑1 (MQ=255) tatatGTAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:830148/68‑1 (MQ=255) tatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:846844/68‑1 (MQ=255) tatatGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAagag < 1:2578360/68‑1 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGtt > 1:652804/1‑43 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:577184/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:3156021/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:2318459/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:3184975/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:2868422/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:310642/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:849273/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:1359169/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:3411628/1‑69 (MQ=255) tGGAAGACCTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATa > 1:2378867/1‑69 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATaa > 1:773225/1‑68 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATaa > 1:3046736/1‑68 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATaa > 1:1839037/1‑68 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATaa > 1:1647589/1‑68 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATaa > 1:571640/1‑68 (MQ=255) gAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATaa > 1:1419916/1‑68 (MQ=255) aGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGaaa > 1:2417583/1‑57 (MQ=255) aGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAag > 1:2176610/1‑58 (MQ=255) aGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAag > 1:2300705/1‑58 (MQ=255) aGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAag > 1:592881/1‑58 (MQ=255) aGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAag > 1:699833/1‑58 (MQ=255) aGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAag > 1:2454463/1‑58 (MQ=255) gaccTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATAAGcc > 1:129963/4‑68 (MQ=255) gaccTGGATCAACGCTGGATGGAATATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGTGATAAGcc > 1:1657991/4‑68 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:2819350/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:3270370/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:3319531/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:3368072/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:2634461/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:55390/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:622972/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1894818/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1064973/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1123932/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1440745/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1589381/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1638802/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:1888868/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:2059199/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:2146955/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:2508495/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCGCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:698390/69‑1 (MQ=255) gATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGGTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:2333658/69‑1 (MQ=255) aTCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:3042014/68‑1 (MQ=255) cTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGAc < 1:2264947/42‑1 (MQ=255) cTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGAc < 1:3174376/42‑1 (MQ=255) cTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGAc < 1:1512098/42‑1 (MQ=255) cTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGAc < 1:3006723/42‑1 (MQ=255) cTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGAc < 1:3039917/42‑1 (MQ=255) tGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTc > 1:2438876/1‑38 (MQ=255) tGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTc > 1:969232/1‑38 (MQ=255) tGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTc > 1:172955/1‑38 (MQ=255) tGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTc > 1:2031690/1‑38 (MQ=255) tGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTc > 1:2062373/1‑38 (MQ=255) tGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTc > 1:3200053/1‑38 (MQ=255) tGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGGCAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCAttct < 1:1343712/69‑1 (MQ=255) tGGATCAACGATGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTc > 1:606179/1‑38 (MQ=255) tCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGTCAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCAttct < 1:1707151/65‑1 (MQ=255) tCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAAGCAttct < 1:286/65‑1 (MQ=255) tCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCAttct < 1:866099/65‑1 (MQ=255) tCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCAttct < 1:3334828/65‑1 (MQ=255) tCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCAttct < 1:2100752/65‑1 (MQ=255) tCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCAttct < 1:549259/65‑1 (MQ=255) tCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCAttct < 1:3292998/65‑1 (MQ=255) tCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCAttct < 1:1414689/65‑1 (MQ=255) tCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCAttct < 1:1028673/65‑1 (MQ=255) tCAACGCTGGAGGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCAttct < 1:2636532/65‑1 (MQ=255) cAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCTTTCTTCctc < 1:3395331/69‑1 (MQ=255) cAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCAttct < 1:1095561/64‑1 (MQ=255) cAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCATTCTTCctc < 1:644293/69‑1 (MQ=255) cAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCATTCTTCctc < 1:1582552/69‑1 (MQ=255) cAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCATTCTTCctc < 1:1619879/69‑1 (MQ=255) cAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCATTCTTCctc < 1:1620365/69‑1 (MQ=255) cAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCATTCTTCctc < 1:188549/69‑1 (MQ=255) cAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCATTCTTCctc < 1:3062209/69‑1 (MQ=255) aaCGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:441144/59‑1 (MQ=255) aaCGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCATTCTTCctc < 1:2513553/68‑1 (MQ=255) aCGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCATTCTTCctc < 1:2187297/67‑1 (MQ=255) ggatggaCTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCa < 1:2715224/53‑1 (MQ=255) | CGAACAACAGGCCATTGCCGACATTACGCCGAAATATATGGAAGATCTGGATCAACGCTGGATGGACTATGGCGTTAAGTTCCTCGACAAGATGGCGAAGAGCGATAAACCATTCTTCCTC > minE/2413370‑2413490 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |