| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 2,514,636 | C→T | 54.3% | E543E (GAG→GAA) | recG ← | ATP‑dependent DNA helicase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 2,514,636 | 0 | C | T | 54.3% | 15.0 / 97.6 | 115 | E543E (GAG→GAA) | recG | ATP‑dependent DNA helicase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (47/5); new base T (17/45); total (65/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-12 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
ATCAGACTGGCGTTAGGCACATCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCGTGTACCAGG > minE/2514571‑2514702 | atcaGACTGGCGTTAGGCACATCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCa > 1:944491/1‑69 (MQ=255)atcaGACTGGCGTTAGGCACATCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCa > 1:3167162/1‑69 (MQ=255) aGACTGGCGTTAGGCCCATCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCt > 1:3172694/1‑69 (MQ=255) aGACTGGCGTTAGGCACATCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCt > 1:980550/1‑69 (MQ=255) aGACTGGCGTTAGGCACATCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCt > 1:2585643/1‑69 (MQ=255) aGACTGGCGTTAGGCACATCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCt > 1:2873913/1‑69 (MQ=255) aGACTGGCGTTAGGCACATCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCt > 1:2877837/1‑69 (MQ=255) aGACTGGCGTTAGGCACATCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCt > 1:1967582/1‑69 (MQ=255) aGACTGGCGTTAGGCACATCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCt > 1:1577278/1‑69 (MQ=255) aGGCACATCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTAAacga > 1:2205856/1‑69 (MQ=255) aGGCACATCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTAAacga > 1:458976/1‑69 (MQ=255) aGGCACATCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGG‑AACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTAAacgac > 1:203564/1‑69 (MQ=255) caTCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGcc > 1:2323382/1‑68 (MQ=255) tCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATc > 1:905446/1‑69 (MQ=255) tCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATc > 1:1342670/1‑69 (MQ=255) tCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATc > 1:1146665/1‑69 (MQ=255) tCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATc > 1:2846337/1‑69 (MQ=255) tCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATc > 1:1237275/1‑69 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:1715280/1‑56 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:2183273/1‑56 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:3370996/1‑56 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:1104387/1‑56 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:186713/1‑56 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:414900/1‑56 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:1077283/1‑56 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:2424070/1‑56 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:535066/1‑56 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:71997/1‑56 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:856969/1‑56 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:2662940/1‑56 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:764688/1‑56 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:850220/1‑56 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAACGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGATc > 1:1618887/1‑46 (MQ=255) cAACACCGACTTCAATAAAGGTAGTGGCAACCAGCAGGTGTAGTTCACCTTGTTTa > 1:3093716/1‑56 (MQ=255) tCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTa > 1:898020/1‑45 (MQ=255) tCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTa > 1:279948/1‑45 (MQ=255) tCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTa > 1:2032729/1‑45 (MQ=255) tCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTa > 1:3395552/1‑45 (MQ=255) tCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTa > 1:1781081/1‑45 (MQ=255) tCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTa > 1:1400682/1‑45 (MQ=255) tCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTa > 1:1396485/1‑45 (MQ=255) tCAATAACGGTTGTGGAAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTa > 1:3384120/1‑45 (MQ=255) aTAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTtctc > 1:1514964/1‑68 (MQ=255) gtgGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTc < 1:2160871/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:3144080/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:3362210/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:304673/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:472922/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:2859455/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:2822737/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:2646332/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:1065353/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:1914087/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:1324770/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:2470139/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:2296923/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:1796638/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:2251705/69‑1 (MQ=255) cagcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:1706930/69‑1 (MQ=255) atcagGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg > 1:3225559/3‑69 (MQ=255) agcagGTGTGGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg > 1:2437335/1‑69 (MQ=255) agcagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGccc < 1:451180/68‑1 (MQ=255) agcagGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGCCGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg > 1:3014820/1‑69 (MQ=255) agcagGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg > 1:596321/1‑69 (MQ=255) agcagGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg > 1:1812029/1‑69 (MQ=255) agcagGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg > 1:1699811/1‑69 (MQ=255) agcagGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg < 1:2498762/69‑1 (MQ=255) agcagGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg > 1:659513/1‑69 (MQ=255) agcagGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg > 1:826749/1‑69 (MQ=255) agcagGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg > 1:1001879/1‑69 (MQ=255) agcagGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg > 1:2347165/1‑69 (MQ=255) agcagGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg > 1:2066149/1‑69 (MQ=255) agcagGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg > 1:2482183/1‑69 (MQ=255) agcagGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTCTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg > 1:1900228/1‑69 (MQ=255) agcagGTGTAGCTCAACTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCg > 1:3306913/1‑69 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAAGGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:3324736/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:1116313/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:636629/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:673688/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:1341912/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:2433313/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:1211831/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:1207817/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:54825/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:1098157/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:962175/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:2573470/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:3036263/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:49827/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:497088/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:488318/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:2231401/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:2184441/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:2176690/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:344109/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:1932451/69‑1 (MQ=255) cagGTGTAGTTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTATCGGCAGGTTTCATCCGCCCgtg < 1:335399/69‑1 (MQ=255) gtgtAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCGTGTAc < 1:1667735/69‑1 (MQ=255) gtgtAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCGTGTAc < 1:161819/69‑1 (MQ=255) gCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCGTGTACCAgg > 1:3332250/1‑68 (MQ=255) | ATCAGACTGGCGTTAGGCACATCAACGCCGACTTCAATAACGGTTGTGGCAACCAGCAGGTGTAGCTCACCTTGTTTAAACGACGCCATCACCGCCTGTTTCTCGGCAGGTTTCATCCGCCCGTGTACCAGG > minE/2514571‑2514702 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |