| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 2,680,432 | G→T | 26.2% | A86A (GCC→GCA) | feoB ← | fused ferrous iron transporter, protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 2,680,432 | 0 | G | T | 26.2% | 243.3 / 74.7 | 152 | A86A (GCC→GCA) | feoB | fused ferrous iron transporter, protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/67); new base T (28/12); total (73/79) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.60e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
CAGTTGTAGCGTCAGGTACAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGCGATGAGATGGTG > minE/2680366‑2680498 | cagTTGTAGCGTCAGGTACAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGc < 1:1798534/69‑1 (MQ=255)cagTTGTAGCGTCAGGTACAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGc < 1:610114/69‑1 (MQ=255) ttGTAGCGTCAGGTACAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTc < 1:2788042/69‑1 (MQ=255) gTAGCGTCAGGTACAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGc < 1:874354/69‑1 (MQ=255) gTAGCGTCAGGTACAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGc < 1:1881564/69‑1 (MQ=255) gTAGCGTCAGGTACAGGTTACGCTCAAGGTTAAACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGc < 1:2893190/69‑1 (MQ=255) tctggTACAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCa < 1:1422963/66‑1 (MQ=255) aGGTACAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCaaa < 1:1852199/69‑1 (MQ=255) aGGTACAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCaaa < 1:2656181/69‑1 (MQ=255) aCATGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCa < 1:322838/63‑1 (MQ=255) aCAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCa < 1:1759307/63‑1 (MQ=255) aCAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCa < 1:1538168/63‑1 (MQ=255) aCAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCa < 1:2146030/63‑1 (MQ=255) aCAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCa < 1:2599265/63‑1 (MQ=255) aCAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCa < 1:2740001/63‑1 (MQ=255) aCAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCa < 1:679040/63‑1 (MQ=255) aCAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGt > 1:539619/1‑69 (MQ=255) aCAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGt > 1:1016565/1‑69 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa < 1:2977340/69‑1 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa > 1:1485110/1‑69 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa < 1:2739102/69‑1 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa < 1:145505/69‑1 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa < 1:2847287/69‑1 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa > 1:661836/1‑69 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa < 1:670096/69‑1 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa < 1:694681/69‑1 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa > 1:1510963/1‑69 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa < 1:2063021/69‑1 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa < 1:2868045/69‑1 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa < 1:2885226/69‑1 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa < 1:3068334/69‑1 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa < 1:819143/69‑1 (MQ=255) cAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTa < 1:2946813/69‑1 (MQ=255) tACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGa > 1:2513439/1‑68 (MQ=255) tACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGAc > 1:2557809/1‑69 (MQ=255) tACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGAc > 1:2440639/1‑69 (MQ=255) tACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGAc > 1:3314713/1‑69 (MQ=255) tACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGAc > 1:2402441/1‑69 (MQ=255) tACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGAc > 1:2401971/1‑69 (MQ=255) tACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGAc > 1:1186558/1‑69 (MQ=255) tACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGAc > 1:1482971/1‑69 (MQ=255) aCGCTCATGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACa > 1:709007/1‑69 (MQ=255) aCGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCATAATGTAGTGACa > 1:1628605/1‑69 (MQ=255) aCGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGAc > 1:3398261/1‑68 (MQ=255) aCGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACa > 1:3285110/1‑69 (MQ=255) aCGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACa > 1:776771/1‑69 (MQ=255) aCGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACa > 1:2672308/1‑69 (MQ=255) aCGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACa > 1:2834179/1‑69 (MQ=255) aCGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACa > 1:1570034/1‑69 (MQ=255) aCGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATATAGTGAc > 1:2197024/1‑68 (MQ=255) aCGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa < 1:1359473/68‑1 (MQ=255) aCGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa < 1:2476547/68‑1 (MQ=255) aCGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa < 1:1335466/68‑1 (MQ=255) aCGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa < 1:1971995/68‑1 (MQ=255) aCGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa < 1:1558305/68‑1 (MQ=255) cGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCa < 1:642775/41‑1 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTc > 1:1470052/1‑65 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTc > 1:2957028/1‑65 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:3307232/1‑66 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:3341619/1‑66 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:986631/1‑66 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:412124/1‑66 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:782414/1‑66 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:3127321/1‑66 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:803734/1‑66 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:92590/1‑66 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:1415248/1‑66 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:2375666/1‑66 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:2372437/1‑66 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:2293828/1‑66 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:2179657/1‑66 (MQ=255) gCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:2613646/1‑66 (MQ=255) gCATCAACCACGTTAATCAGCAGGTCTGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCa > 1:2005592/1‑66 (MQ=255) caccacGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATcgagcga > 1:2172813/1‑69 (MQ=255) caccacGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATcgagcga > 1:1145457/1‑69 (MQ=255) caccacGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATcgagcga > 1:3031253/1‑69 (MQ=255) caccacGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATcgagcga > 1:3089616/1‑69 (MQ=255) cGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCg < 1:1911613/47‑1 (MQ=255) cGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCg < 1:2165460/47‑1 (MQ=255) cGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCg < 1:1838435/47‑1 (MQ=255) cGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCg < 1:2341791/47‑1 (MQ=255) cGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCg < 1:406873/47‑1 (MQ=255) ttAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGc < 1:1756140/69‑1 (MQ=255) ttAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGc < 1:3289193/69‑1 (MQ=255) ttAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGc > 1:2889340/1‑69 (MQ=255) ttAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGc < 1:2675887/69‑1 (MQ=255) ttAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGc < 1:2536691/69‑1 (MQ=255) ttAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGc < 1:348494/69‑1 (MQ=255) aaTCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGCg > 1:1790069/1‑68 (MQ=255) tCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCAt > 1:948862/1‑43 (MQ=255) tCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGCGATGAGAtggtg > 1:352632/1‑69 (MQ=255) tCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGCGATGAGAtggtg > 1:2542143/1‑69 (MQ=255) tCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGCGATGAGAtggtg > 1:3574/1‑69 (MQ=255) tCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGCGATGAGAtggtg > 1:2820284/1‑69 (MQ=255) tCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGCGATGAGAtggtg > 1:84984/1‑69 (MQ=255) tCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGCGATGAGAtggtg > 1:1015633/1‑69 (MQ=255) tCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGCGATGAGAtggtg > 1:2439137/1‑69 (MQ=255) cGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATcgagcg < 1:256631/48‑1 (MQ=255) cGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATcgagcg < 1:541536/48‑1 (MQ=255) cGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATcgagcg < 1:1880598/48‑1 (MQ=255) | CAGTTGTAGCGTCAGGTACAGGTTACGCTCAAGGTTAGACGCATCCACCACGTTAATCAGCAGGTCGGCGTCGCCACTCAAAATGTAGTGACAGGCGATTTGCTCATCGAGCGAGGTCTGCGATGAGATGGTG > minE/2680366‑2680498 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |