| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 2,725,709 | A→G | 68.2% | T458T (ACT→ACC) | yheS ← | fused predicted transporter subunits and ATP‑binding components of ABC superfamily |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 2,725,709 | 0 | A | G | 68.2% | 61.0 / 33.9 | 72 | T458T (ACT→ACC) | yheS | fused predicted transporter subunits and ATP‑binding components of ABC superfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/20); new base G (31/18); total (34/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.43e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.22e-01 | |||||||||||
TCAAACTCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAATTAATGCC > minE/2725653‑2725760 | tCAAACTCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTtcgtcg > 1:2841776/1‑69 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGtt > 1:2909259/1‑58 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCTTCGagca > 1:132108/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:91210/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:739610/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:2180119/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:2527203/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:2121835/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:2075369/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:666367/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:2820286/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:1638823/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:1587891/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:2925014/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:1322660/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:3221169/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:537263/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:871542/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:1079946/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:398811/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagca > 1:3355609/1‑67 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGagc > 1:1573412/1‑66 (MQ=255) tCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGag > 1:2650869/1‑65 (MQ=255) aaTGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGa < 1:668973/69‑1 (MQ=255) cTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCg < 1:3033633/69‑1 (MQ=255) cTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCg < 1:2655002/69‑1 (MQ=255) cTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCg < 1:2274021/69‑1 (MQ=255) cTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCg < 1:1369251/69‑1 (MQ=255) gAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCt > 1:1707328/1‑68 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAgcagccgca > 1:1014897/1‑40 (MQ=17) tCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAgcagcagca > 1:329665/1‑40 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAgcagcagca > 1:2083037/1‑40 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAgcagcagca > 1:2562810/1‑40 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAgcagcagca > 1:1028561/1‑40 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAgcagcagca > 1:3261541/1‑40 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAgcagcagca > 1:3248850/1‑40 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAgcagcagca > 1:8384/1‑40 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAgcagcagca > 1:3090176/1‑40 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAAtt < 1:1488245/63‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAAtt < 1:1261112/63‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAAtt < 1:322772/63‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAAtt < 1:866816/63‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAAtt < 1:583650/63‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAAtt < 1:30799/63‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAAtt < 1:2361442/63‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAAtt < 1:849538/63‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAAtt < 1:1830677/63‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAAtt < 1:2724279/63‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAAtt < 1:779981/63‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAAtt < 1:2057432/63‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAAtt < 1:2604264/63‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAAtt < 1:2158769/63‑1 (MQ=255) tCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAATTAATGcc > 1:1010612/1‑69 (MQ=255) gAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCg < 1:534900/44‑1 (MQ=255) tCAAGGTGTTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:812096/38‑1 (MQ=14) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:3292025/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:1006196/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:909302/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:1199446/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:1291350/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:1696975/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:821846/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:1915359/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:2543226/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:2771964/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:601803/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:312461/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:327402/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:440545/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:3294830/38‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGGTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:1524572/38‑1 (MQ=14) cAAGGTGGTTGGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGAtt < 1:2403971/37‑1 (MQ=255) | TCAAACTCGATTAATGCTTCGGTGAGTGCCTGACGCATGTCGAGGTCAAGGTGGTTAGTCGGTTCGTCGAGCAGCAGCAGATTCGGCCGCTGCCAGACAATTAATGCC > minE/2725653‑2725760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |