| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 2,733,525 | T→C | 33.7% | G40G (GGT→GGC) | yheL → | predicted intracellular sulfur oxidation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 2,733,525 | 0 | T | C | 33.7% | 114.5 / 87.0 | 151 | G40G (GGT→GGC) | yheL | predicted intracellular sulfur oxidation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/55); new base C (33/18); total (78/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.57e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
GCGTCTGCTCAGTGAAGGAGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCTTATTG > minE/2733459‑2733592 | gcGTCTGCTCAGTGAAGGAGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGt < 1:689667/67‑1 (MQ=255) cTGCTCAGTGAAGGAGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGc < 1:906048/69‑1 (MQ=255) cTGCTCAGTGAAGGAGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGc < 1:3255259/69‑1 (MQ=255) cTGCTCAGCGAAGGAGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGc < 1:850104/69‑1 (MQ=255) tGCTCAGTGAAGGAGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTTACCGc < 1:904017/68‑1 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACTGCt > 1:2865823/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:1791844/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:2325499/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:3134981/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:2271421/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:2221177/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:2217210/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:2339602/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:3238111/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:2714241/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:1693370/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:1675836/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:2527555/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:3064548/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:656200/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:566472/1‑67 (MQ=255) cTCAGTGAAGGTGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCt > 1:510258/1‑67 (MQ=255) gAAGGAGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCt > 1:1946438/1‑61 (MQ=255) gAAGGAGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCt > 1:2279110/1‑61 (MQ=255) gAAGGAGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCt > 1:1292544/1‑61 (MQ=255) gAAGGAGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCt > 1:60673/1‑61 (MQ=255) gAAGGAGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCt > 1:3260062/1‑61 (MQ=255) gAAGGAGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCt > 1:425171/1‑61 (MQ=255) gAAGGAGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCt > 1:1737285/1‑61 (MQ=255) tgaCGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCTACCTTGGAAGTCt < 1:3020482/68‑1 (MQ=255) tgaCGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCTACCTTGAAAGTCt < 1:289886/68‑1 (MQ=255) tgaCGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCTACCTTGAAAGTCt < 1:328964/68‑1 (MQ=255) tgaCGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCTACCTTGAAAGTCt < 1:1825655/68‑1 (MQ=255) tgaCGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCTACCTTGAAAGTCt < 1:1061656/68‑1 (MQ=255) tgaCGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCTACCTTGAAAGTCt < 1:2604934/68‑1 (MQ=255) tgaCGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCTACCTTGAAAGTCt < 1:1616529/68‑1 (MQ=255) tgaCGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCTACCTTGAAAGTCt < 1:880795/68‑1 (MQ=255) tgaCGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCTACCTTGAAAGTCt < 1:1591731/68‑1 (MQ=255) tgaCGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCTACCTTGAAAGTCt < 1:1260893/68‑1 (MQ=255) tgaCGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCTACCTTGAAAGTCt < 1:1537981/68‑1 (MQ=255) gaCGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGCAACCGCTACCTTGAAAGTCt < 1:244802/68‑1 (MQ=255) gAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGt < 1:3002348/69‑1 (MQ=255) gAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGt < 1:2172298/69‑1 (MQ=255) gAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGt < 1:2966130/69‑1 (MQ=255) gAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGt < 1:1504752/69‑1 (MQ=255) gAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGt < 1:1174318/69‑1 (MQ=255) aaCTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGGGt < 1:1465208/68‑1 (MQ=255) aaCTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGt < 1:3193013/68‑1 (MQ=255) aaCTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGt < 1:2095934/68‑1 (MQ=255) aCTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGGAAGTCTGCGTaa > 1:3277683/1‑69 (MQ=255) aCTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTaa > 1:3100524/1‑69 (MQ=255) aCTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTaa > 1:759392/1‑69 (MQ=255) aCTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTaa > 1:377161/1‑69 (MQ=255) aCTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTaa > 1:55102/1‑69 (MQ=255) aCTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTaa > 1:958631/1‑69 (MQ=255) aCTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTaa > 1:1112252/1‑69 (MQ=255) aCTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTaa > 1:2694590/1‑69 (MQ=255) aCTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTaa > 1:253417/1‑69 (MQ=255) aCTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTa > 1:3436458/1‑68 (MQ=255) attGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGccccc > 1:3099422/1‑67 (MQ=255) attGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCa > 1:1361/1‑68 (MQ=255) attGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCa > 1:1524139/1‑68 (MQ=255) attGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCa > 1:424087/1‑68 (MQ=255) attGCAAGATGGCGTAACTGACGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGccacca > 1:2132661/1‑68 (MQ=255) gATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGt < 1:1330602/51‑1 (MQ=255) gATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTc < 1:2493997/69‑1 (MQ=255) gTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGt < 1:2907570/45‑1 (MQ=255) aCTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTg > 1:2022479/1‑69 (MQ=255) gCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACg < 1:694323/67‑1 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGAcc > 1:2504534/1‑68 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt < 1:373127/69‑1 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt < 1:1425360/69‑1 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt < 1:1262843/69‑1 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt < 1:592011/69‑1 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt < 1:1360303/69‑1 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt < 1:2870785/69‑1 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt < 1:765109/69‑1 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt > 1:1009097/1‑69 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt < 1:100747/69‑1 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt < 1:3427655/69‑1 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt < 1:3360103/69‑1 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt < 1:1933954/69‑1 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt < 1:2335806/69‑1 (MQ=255) tGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt < 1:2441472/69‑1 (MQ=255) gACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGaa > 1:2774138/1‑63 (MQ=255) gACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGaa > 1:2037062/1‑63 (MQ=255) gACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGaa > 1:3061845/1‑63 (MQ=255) gACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGaa > 1:1172264/1‑63 (MQ=255) gACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGaa > 1:618326/1‑63 (MQ=255) gACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGaa > 1:3118469/1‑63 (MQ=255) gACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCtt < 1:3366396/69‑1 (MQ=255) gACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCtt < 1:2963257/69‑1 (MQ=255) gACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCtt < 1:1168223/69‑1 (MQ=255) gACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCtt < 1:1953991/69‑1 (MQ=255) gACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCtt < 1:188448/69‑1 (MQ=255) gACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCt < 1:1163913/68‑1 (MQ=255) gTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCTTATTg < 1:3161780/69‑1 (MQ=255) gTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCTTATTg < 1:2298194/69‑1 (MQ=255) gTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCTTATTg < 1:1848117/69‑1 (MQ=255) gTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCTTATTg < 1:2804048/69‑1 (MQ=255) | GCGTCTGCTCAGTGAAGGAGACGAACTGCTATTATTGCAAGATGGCGTAACTGCCGCAGTTGACGGTAACCGCTACCTTGAAAGTCTGCGTAATGCCCCCATTAAGGTCTATGCCCTGAACGAAGACCTTATTG > minE/2733459‑2733592 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |