| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 2,733,673 | C→T | 31.5% | P90S (CCC→TCC) | yheL → | predicted intracellular sulfur oxidation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 2,733,673 | 0 | C | T | 31.5% | 105.4 / 56.1 | 114 | P90S (CCC→TCC) | yheL | predicted intracellular sulfur oxidation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/34); new base T (20/16); total (64/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TGGTCAAATTTCGAACGACATCATTCTCATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCGC > minE/2733606‑2733736 | tGGTCAAATTTCGAACGACATCATTCTCATTGACTATACTGATTTCGTCTGACTTACGGTTAAGCA‑cc < 1:2661421/68‑1 (MQ=255)tGGTCAAATTTCGAACGACATCATTCTCATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑cc < 1:2186732/68‑1 (MQ=255)tGGTCAAATTTCGAACGACATCATTCTCATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑cc < 1:2287360/68‑1 (MQ=255)tGGTCAAATTTCGAACGACATCATTCTCATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑cc < 1:1843147/68‑1 (MQ=255) gTCAAATTTCGAACGACATCATTCTCATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCcca > 1:3337698/1‑69 (MQ=255) atatCGAACGACATCATTCTCAATGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCccagcca < 1:743673/65‑1 (MQ=255) aTTTCTAACGACATCATTCTCATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCccagcca < 1:572801/68‑1 (MQ=255) aTTTCGAACGACATCATTCTCATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCccagcca < 1:1195793/68‑1 (MQ=255) aTTTCGAACGACATCATTCTCATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCccagcca < 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atTCTCATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATgg > 1:2309196/1‑69 (MQ=255) atTCTCATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATgg > 1:2916439/1‑69 (MQ=255) atTCTCATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATgg > 1:2910773/1‑69 (MQ=255) atTCTCATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATg > 1:1970172/1‑68 (MQ=255) tcccATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGc < 1:2894487/65‑1 (MQ=255) tcccATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGc < 1:3199689/65‑1 (MQ=255) tcccATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGc < 1:906781/65‑1 (MQ=255) tcccATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGc < 1:2563160/65‑1 (MQ=255) tcccATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGc < 1:2512831/65‑1 (MQ=255) tcccATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGc < 1:2509060/65‑1 (MQ=255) tcccATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGc < 1:2819004/65‑1 (MQ=255) tcccATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGc < 1:3348391/65‑1 (MQ=255) tcccATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGc < 1:967662/65‑1 (MQ=255) tcccATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGc < 1:1081599/65‑1 (MQ=255) tcccATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGc < 1:1575001/65‑1 (MQ=255) tcccATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGc < 1:1900832/65‑1 (MQ=255) tcccATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGc < 1:149598/65‑1 (MQ=255) tcccATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGCGATGGc < 1:2180207/65‑1 (MQ=255) ctcATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCgg > 1:1814551/1‑69 (MQ=255) gACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATcat > 1:500557/1‑67 (MQ=255) gACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGt > 1:2509559/1‑69 (MQ=255) gACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGt > 1:514435/1‑69 (MQ=255) gACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGt > 1:818758/1‑69 (MQ=255) ataCTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGta < 1:1301977/69‑1 (MQ=255) taCTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGtat > 1:504640/1‑69 (MQ=255) taCTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGtat > 1:1853993/1‑69 (MQ=255) aCTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGta < 1:3065899/67‑1 (MQ=255) cTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGtata > 1:225185/1‑68 (MQ=255) cTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGtata > 1:3386104/1‑68 (MQ=255) cTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGtata > 1:693766/1‑68 (MQ=255) cTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGtata > 1:2087296/1‑68 (MQ=255) cTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTatat > 1:3049854/1‑69 (MQ=255) cTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTatat > 1:1671473/1‑69 (MQ=255) cTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTatat > 1:165728/1‑69 (MQ=255) aTTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTc > 1:367709/1‑69 (MQ=255) ttCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCtt < 1:1732909/69‑1 (MQ=255) ttCGTCAGACTTACGGTTAAGAA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCtt < 1:590375/69‑1 (MQ=255) cAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCTTTGTATATTTCTTGacac < 1:878939/69‑1 (MQ=255) cAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGacac < 1:349133/69‑1 (MQ=255) cAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGacac < 1:3375325/69‑1 (MQ=255) cAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGacac < 1:3418632/69‑1 (MQ=255) cAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGacac < 1:2142694/69‑1 (MQ=255) cAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGacac < 1:1274035/69‑1 (MQ=255) cAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGacac < 1:1134881/69‑1 (MQ=255) cAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGacac < 1:2863671/69‑1 (MQ=255) aGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGacac < 1:3156651/68‑1 (MQ=255) aGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGacac < 1:2753449/68‑1 (MQ=255) aCTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCtt > 1:3184484/1‑69 (MQ=255) aCTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCtt > 1:24277/1‑69 (MQ=255) aCTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCtt > 1:1472448/1‑69 (MQ=255) 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aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCtt > 1:2727684/1‑51 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCt > 1:771512/1‑50 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCtt > 1:2688178/1‑59 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:1513959/1‑69 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:1528803/1‑69 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:1116579/1‑69 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:1802713/1‑69 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:885645/1‑69 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:516410/1‑69 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:3099633/1‑69 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:2304440/1‑69 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:3142810/1‑69 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:3149577/1‑69 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:2337506/1‑69 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:1407635/1‑69 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:3233214/1‑69 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:1602315/1‑69 (MQ=255) aaGCA‑CTCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGAGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCg > 1:727864/1‑69 (MQ=255) gCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCGc < 1:754088/68‑1 (MQ=255) | TGGTCAAATTTCGAACGACATCATTCTCATTGACTATACTGATTTCGTCAGACTTACGGTTAAGCA‑CCCCAGCCAGATGGCCTGGTGATGGCGGGATCGTTGTATATTTCTTGACACCTTTTCGGCATCGC > minE/2733606‑2733736 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |