| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | minE | 369,416 | G→A | 37.8% | Q121Q (CAG→CAA) | entF → | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | minE | 369,416 | 0 | G | A | 37.8% | 42.9 / 46.4 | 74 | Q121Q (CAG→CAA) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (26/20); new base A (13/15); total (39/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.27e-01 | |||||||||||
GCATTAATGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGAT > minE/369348‑369479 | gCATTAATGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCGCTGGTCTTTCATCAg > 1:382781/1‑69 (MQ=255)gCATTAATGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAg > 1:901834/1‑69 (MQ=255)gCATTAATGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAg > 1:2012883/1‑69 (MQ=255)gCATTAATGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAg > 1:2438089/1‑69 (MQ=255)gCATTAATGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAg > 1:1623350/1‑69 (MQ=255)gCATTAATGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAg > 1:161141/1‑69 (MQ=255)gCATTAATGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAg > 1:1591357/1‑69 (MQ=255)gCATTAATGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAg > 1:2497243/1‑69 (MQ=255)gCATTAATGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAg > 1:3362790/1‑69 (MQ=255)gCATTAATGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAg > 1:3365084/1‑69 (MQ=255)gCATTAATGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAg > 1:1210699/1‑69 (MQ=255)gCATTAATGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAg > 1:738089/1‑69 (MQ=255) aaTGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa > 1:2962222/1‑68 (MQ=255) aaTGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa > 1:2958253/1‑68 (MQ=255) aaTGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa > 1:2507590/1‑68 (MQ=255) aaTGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa > 1:849648/1‑68 (MQ=255) aaTGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa > 1:229619/1‑68 (MQ=255) aaTGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa > 1:947335/1‑68 (MQ=255) aaTGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa > 1:1104460/1‑68 (MQ=255) aaTGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa > 1:1736529/1‑68 (MQ=255) aaTGCAGGCGGATATGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa > 1:3364926/1‑68 (MQ=255) tttGCAACAAGATCTGCGCGTCGTTAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa < 1:2850255/56‑1 (MQ=255) tttGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa > 1:483857/1‑56 (MQ=255) tttGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa < 1:1655380/56‑1 (MQ=255) tttGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa < 1:3340986/56‑1 (MQ=255) tttGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa > 1:2089763/1‑56 (MQ=255) tttGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa < 1:2087258/56‑1 (MQ=255) tttGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa > 1:2673826/1‑56 (MQ=255) tttGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa > 1:3201522/1‑56 (MQ=255) tttGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa < 1:2734997/56‑1 (MQ=255) tttGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGa > 1:2854032/1‑56 (MQ=255) tttGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCgg > 1:1191908/1‑68 (MQ=255) tttGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCgg > 1:1341545/1‑68 (MQ=255) tttGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCgg > 1:2145187/1‑68 (MQ=255) tGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATa < 1:460495/69‑1 (MQ=255) tGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATa < 1:3051163/69‑1 (MQ=255) cgTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGctggtactggt < 1:334314/68‑1 (MQ=255) cgTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGctggtactggt < 1:417331/68‑1 (MQ=255) cgTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGctggtactggt < 1:1269772/68‑1 (MQ=255) cgTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGctggtactgg < 1:1191115/67‑1 (MQ=255) cgTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGctggtactgg < 1:2034790/67‑1 (MQ=255) cgTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGctggtactgg < 1:1928213/67‑1 (MQ=255) cgTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGctggtactgg < 1:1924318/67‑1 (MQ=255) cgTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGctggtactgg < 1:1913596/67‑1 (MQ=255) gCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGtt < 1:1747202/69‑1 (MQ=255) gCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGtt < 1:1029497/69‑1 (MQ=255) gCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGtt < 1:2445941/69‑1 (MQ=255) gCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGtt < 1:2024736/69‑1 (MQ=255) gCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGtt < 1:3001636/69‑1 (MQ=255) gtttCATCAACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTgg > 1:2343808/2‑68 (MQ=255) cTTTCATCAACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTgg > 1:3373929/1‑68 (MQ=255) cTTTCATCAACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTgg > 1:3179941/1‑68 (MQ=255) cTTTCATCAACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTgg > 1:1001258/1‑68 (MQ=255) cTTTCATCAACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTgg > 1:3234607/1‑68 (MQ=255) cTTTCATCAACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTgg > 1:2690454/1‑68 (MQ=255) cTTTCATCAACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTgg > 1:2645588/1‑68 (MQ=255) cTTTCATCAACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTgg > 1:263148/1‑68 (MQ=255) cTTTCATCAACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTgg > 1:581284/1‑68 (MQ=255) cTTTCATCAACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTgg > 1:2100053/1‑68 (MQ=255) cTTTCATCAACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTgg > 1:2045288/1‑68 (MQ=255) cTTTCATCAACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTg > 1:2676331/1‑67 (MQ=255) cTTTCATCAACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGATgg > 1:2161721/1‑68 (MQ=255) atcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTTGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:3337708/66‑1 (MQ=255) atcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:352587/66‑1 (MQ=255) atcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:1286595/66‑1 (MQ=255) atcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:849012/66‑1 (MQ=255) atcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:285255/66‑1 (MQ=255) atcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:2495388/66‑1 (MQ=255) atcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:1761865/66‑1 (MQ=255) atcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:1680723/66‑1 (MQ=255) atcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:2444743/66‑1 (MQ=255) atcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:1443683/66‑1 (MQ=255) atcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:2880209/66‑1 (MQ=255) atcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:1314606/66‑1 (MQ=255) atcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:3019481/66‑1 (MQ=255) atcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:3153563/66‑1 (MQ=255) tcaACTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCg < 1:3008182/65‑1 (MQ=255) aGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGAt > 1:1382125/1‑65 (MQ=255) aGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGAt > 1:3299055/1‑65 (MQ=255) aGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGAt > 1:2414272/1‑65 (MQ=255) aGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGAt > 1:3093681/1‑65 (MQ=255) aGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGAt > 1:706412/1‑65 (MQ=255) aGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGAt > 1:2273251/1‑65 (MQ=255) aGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGAt > 1:1918825/1‑65 (MQ=255) aGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGAt > 1:1899749/1‑65 (MQ=255) aGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGAt > 1:1802921/1‑65 (MQ=255) | GCATTAATGCAGGCGGATTTGCAACAAGATCTGCGCGTCGATAGCGGTAAACCACTGGTCTTTCATCAGCTGATACAGGTGGCGGATAACCGCTGGTACTGGTATCAGCGTTATCACCATTTGCTGGTCGAT > minE/369348‑369479 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |