Missing coverage evidence...
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CCTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAG  >  minE/485881‑485947                                                                   | ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:2044850/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:976343/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:924057/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:71942/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:644718/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:2843678/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:2771105/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:2745484/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:2699452/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:258282/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:2476856/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:2468071/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:2413010/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:2164040/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:2093240/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:1000195/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:1909004/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:1832702/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:1828734/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:1722848/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:1714221/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:16564/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:1645687/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:1608286/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:1433814/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:1361965/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:1180260/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:107027/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:1050922/67‑1 (MQ=255) ccTGGGTGAACGGCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAg  <  1:104393/67‑1 (MQ=255)                                                                   | CCTGGGTGAACGTCGTGCGAACGCCGTTAAGATGTACCTGCAGGGTAAAGGCGTTTCTGCAGACCAG  >  minE/485881‑485947

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑