Missing coverage evidence...
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CAACAGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGACACTTTCACTTT  >  minE/519046‑519116                                                                       | caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGTCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:2297660/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:2613203/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:997771/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:971481/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:887084/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:671305/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:629288/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:545757/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:465060/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:2730261/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:2632090/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:2603559/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:2556584/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:2501758/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:2411251/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:1998741/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:1784241/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:1535616/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:1144333/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:1102026/71‑1 (MQ=255) caacaGGCTAACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:429310/71‑1 (MQ=255)   actggCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGAcactttcacttt  <  1:1018665/66‑1 (MQ=255)                                                                       | CAACAGGCTGACTGGGTGTTAGTGGAAGGTGCTGGCGGCTGGTTTACGCCGCTTTCTGACACTTTCACTTT  >  minE/519046‑519116

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑