Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	649454	649462	9	52 [0]	[0] 3	pepN	aminopeptidase N

GCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACT  >  minE/649385‑649453                                                                     | gCTTTTGGTGAAACGCCTCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2744763/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCGCGAAGCAAACAATATGACt  <  1:43004/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:275837/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1095083/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2401095/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2444459/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2450403/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2553295/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2608508/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2617544/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2617881/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2627840/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2666508/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2683936/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2393240/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2843857/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:395216/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:411680/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:476841/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:566301/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:652689/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:707090/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:749679/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:789163/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:976772/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:99450/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:163426/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:118053/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1248367/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1278407/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1349935/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:136342/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1416839/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1575439/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1590392/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1608401/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2288539/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1641535/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1680267/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1813082/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1829212/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2025938/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2032899/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2036768/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2087043/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2141841/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2227027/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2269311/69‑1 (MQ=255) gCTTTTGGTCAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1252806/69‑1 (MQ=255)  cTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:2543664/68‑1 (MQ=255)   ttttGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1333667/67‑1 (MQ=255)           aaaCGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACt  <  1:1269065/59‑1 (MQ=255)                                                                     | GCTTTTGGTGAAACGCATCTGGCTGATGTGCTGGTGAGCAAGCAGTTCCACGAAGCAAACAATATGACT  >  minE/649385‑649453

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑