Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	676231	676234	4	38 [0]	[0] 5	ompA	outer membrane protein A (3a;II*;G;d)

GAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGCC  >  minE/676161‑676230                                                                      | gaactgctTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:2512333/67‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCTGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:359327/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCGGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:1887020/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:619175/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:2753865/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:326145/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:335830/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:356585/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:444090/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:487765/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:523320/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:2686198/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:710413/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:72794/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:728895/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:762008/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:781044/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:790338/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:813910/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:880060/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:1892008/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:1268245/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:1380123/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:1680172/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:1751342/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:1779525/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:178725/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:1876916/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:187756/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:1038160/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:1921506/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:1928556/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:2219031/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:2338994/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:2417971/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:2526321/70‑1 (MQ=255) gAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:259622/70‑1 (MQ=255)  aGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACTGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGcc  <  1:605961/69‑1 (MQ=255)                                                                      | GAGCTGCTTCGCCCTGACCGAAACGGTAGGAAACACCCAGGCTCAGCATGCCGTTGTCCGGACGAGTGCC  >  minE/676161‑676230

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑