Missing coverage evidence...
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CTCAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCAGAG  >  minE/684281‑684348                                                                    | ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGTTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:2056876/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCatag  <  1:1013640/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:464924/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:2540560/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:2597696/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:269590/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:2746742/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:2802152/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:285876/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:302200/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:367430/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:45433/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:226098/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:541937/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:542844/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:550277/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:661433/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:753871/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:761572/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:783212/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:86485/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:921075/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:930102/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:958609/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:1959272/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:1081835/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:1087195/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:1112410/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:1256431/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:1276316/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:1426378/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:1511762/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:1690469/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:1816807/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:2282156/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:1983369/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:1989175/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:2063269/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:2093508/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:2112668/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:2189767/68‑1 (MQ=255) ctcAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:2225425/68‑1 (MQ=255) ctcAACCCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:2544363/68‑1 (MQ=255)                tAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATTCTGTCCGCACCGCTCAGCagag  <  1:1916044/53‑1 (MQ=255)                    tGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGGCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:2169583/49‑1 (MQ=255)                            tCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:2010439/41‑1 (MQ=255)                              cATTATCGAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCagag  <  1:1912437/39‑1 (MQ=255)                                                                    | CTCAACGCGAAACACTAACTGATGCGGTCCATTATCCAGTTCAATGCTGTCCGCACCGCGCAGCAGAG  >  minE/684281‑684348

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑